鸭MHC I 轻链 cDNA克隆及其蛋白的二级结构 |
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引用本文: | 阮小飞;蒋一男;高凤山;陈卫红;郝慧芳;夏,春.鸭MHC I 轻链 cDNA克隆及其蛋白的二级结构[J].农业生物技术学报,2007,15(1):41-45. |
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作者姓名: | 阮小飞;蒋一男;高凤山;陈卫红;郝慧芳;夏 春 |
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摘 要: | 为了阐明鸭主要组织相容性复合体 I 结构并推进其功能研究,本文采用Full RACE PCR法从其淋巴细胞cDNA文库中克隆了鸭MHC I 轻链 (b2m) cDNA. 随后,在pMAL-p2X/E.coli TB1原核表达系中可溶性表达了其成熟肽蛋白基因,并进行了纯化、蛋白酶切和Western Blot鉴定. 最后,测定了融合蛋白和MBP单体的圆二色谱(CD)值. 鸭b2m cDNA长792 bp,包含18 bp 5’端和414bp 3’端非翻译区. 其ORF为119个氨基酸 (aa),包含20个aa信号肽和99 aa成熟肽。成熟肽序列的第25位和80位为半胱氨酸(C),第80位半胱氨酸附近序列为“YTCRVDH”,与免疫球蛋白超基因家族的特征基序 “F/YCXV/AXH”相符.氨基酸序列与鸡、鱼、蛙、人和鼠β2m比较,同源性在30.3%-65.9%之间. CD测定结果表明鸭b2m α螺旋、β折叠、转角、随机卷曲分别为0 aa、50 aa、23 aa 和26 aa,呈典型的β折叠。同源模建也显示鸭b2m 三级结构(3D)由7个β片层折叠而成,不含α螺旋,这与CD测定结果相符合,并与人和小鼠b2m 3D结构相似.
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关 键 词: | 鸭 b2m 二级结构 同源模建 |
收稿时间: | 2006-4-3 |
修稿时间: | 2006-6-16 |
cDNA cloning and protein structures of duck MHC class I light chain (Anpl-b2m) |
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