| 基于BOX-PCR和REP-PCR技术青枯雷尔氏菌遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 林海云,车建美,刘波,郑雪芳,肖荣凤.基于BOX-PCR和REP-PCR技术青枯雷尔氏菌遗传多样性分析[J].农业生物技术学报,2011,19(6). |
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| 作者姓名： | 林海云 车建美 刘波 郑雪芳 肖荣凤 |
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| 作者单位： | 1. 福建省农业科学院农业生物资源研究所,福州350003;福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室,福州350002
2. 福建省农业科学院农业生物资源研究所,福州,350003 |
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| 基金项目： | 国家自然基金(No.30871667); 福建省自然基金项目(No.2008J0054);福建省自然基金项目(No.2009J01087); 福建省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队建设基金(No.STIF-Y03)共同资助 |
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| 摘 要： | 青枯雷尔氏菌(Ralstonias olanace arum)能够对许多重要作物引起致命性萎蔫病害,广泛分布在热带、亚热带以及温带地区.研究青枯雷尔氏菌的遗传多样性对于了解青枯病的发生和流行具有十分重要的意义.本研究利用青枯雷尔氏菌特异性引物鉴定84株来自福建地区不同寄主的青枯雷尔氏菌,结果表明,这些菌株均在504 bp位置出现特异性条带.同时采用BOX插入因子PCR(BOX-PCR)和重复基因外回文序列PCR(REP-PCR)对这些菌株进行基因多样性研究,基于它们所扩增出的基因指纹图谱表明,BOX-PCR扩增出19条特异性条带,REP-PCR扩增出20条特异性条带.系统聚类结果表明,青枯雷尔氏菌的遗传分化与寄主作物和地理来源都存在相关性,其中,寄主植物是在遗传差异中起主导作用.进一步分析可知,地域性的差异主要由BOX-PCR提供,寄主间的差异主要由REP-PCR提供.不同地理来源的青枯雷尔氏菌在BOX-PCR中可扩增出各自特异性条带,在REP-PCR中同样具有与各个寄主相对应的特异性条带,利用这些特异性条带可以很容易区分不同寄主以及来源的青枯雷尔氏菌.BOX-PCR和REP-PCR多态性分析技术可为我国青枯雷尔氏菌基因多样性的研究提供另一条途径.
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| 关 键 词： | 青枯雷尔氏菌 遗传多样性 BOX-PCR REP-PCR 菌株鉴定 |
Genetic Diversity Analysis of Ralstonia solanacearum Based on BOX-PCR and REP-PCR |
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| Lin Haiyun
,
Che Jianmei
,
Liu Bo
,
Zheng Xuefang
,
Xiao Rongfeng.Genetic Diversity Analysis of Ralstonia solanacearum Based on BOX-PCR and REP-PCR[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2011,19(6). |
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| Authors: | Lin Haiyun Che Jianmei Liu Bo Zheng Xuefang Xiao Rongfeng |
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| Institution: | Lin Haiyun1,2 Che Jianmei1 Liu Bo1 * Zheng Xuefang1 Xiao Rongfeng1 1 Agricultural Bio-resources Research Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences,Fuzhou 350003,China,2 Key Laboratory of Biopesticide and Chemical Biology,Ministry of Education,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002 |
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| Abstract: | Ralstonia solanacearum causes a lethal wilting disease on many important crops in tropical,subtropical and warm regions in the world.The research of genetic diversity of R.solanacearum plays an important part in knowing the appearance and prevalence of bacterial wilt diseases.The special primer was used to identify R.solanacearum strains,in which 84 strains of R.solanacearum from different host plants in the Fujian Province were identified with a specific band in the location of 504 bp.Meanwhile,the genetic... |
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| Keywords: | Ralstonia solanacearum Genetic diversity BOX-PCR REP-PCR Strain identification |
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