甘薯多酚氧化酶cDNA的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 彭世清,陈守才.甘薯多酚氧化酶cDNA的克隆及序列分析[J].农业生物技术学报,2002,10(3):241-245. |
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作者姓名: | 彭世清 陈守才 |
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作者单位: | 中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室,海口,571101 |
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摘 要: | 植物多酚氧化酶(olyphenol oxidase,PPO)是一类核编码的铜金属酶,含有2个保守的铜结合区域(CuA和CuB),N端和C端部分缺乏明显的同源性。根据植物PPO的结构特点,从2个保守的铜结合区域的氨基酸序列设计一对简并引物,扩增了甘薯(Ipomoea batatas L.) PPO保守区之间的cDNA片段,测序表明该片段含595bp,编码195个氨基酸,推导的氨基酸序列包含了植物PPO的2个保守的铜结合区域,与葡萄(Vitis vinifera),番茄(Lycopersicon esculentum)马铃薯(Solanum tuberosum)和蚕豆(Vicia faba)PPO保守区的同源性分别为71.3%,80.8%,79.8%,70.6%。在此基础上设计引物通过3'RACE和5'RACE的方法获得了甘薯PPO cDNA的3'和5'端的片段。最后根据保守区的cDNA片段,3'RACD片段和5'RACE片段的序列信息进行拼接,推导出甘薯PPO cDNA的全部序列信息。结果表明:甘薯PPO cDNA全长含1984bp,有完整的阅读框,编码588个氨基酸。另外5'非翻译区16bp,3'非翻译区202bp,其中包括1个多聚腺苷酸化信号AATAAA,以及1个含17个腺苷酸的ploy(A)尾。由甘薯PPO cDNA推导的氨基酸邓列由葡萄,番茄,马铃薯和蚕豆PPO cDNA推导的氨基酸序列进行比较,它们之间存在较明显的同源性,同源性分别为49%,48%,47%和49%。
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关 键 词: | 甘薯 多酚氧化酶 cDNA 克隆 序列分析 同源性分析 |
修稿时间: | 2001年11月12 |
Cloning and Sequence Analysis of Sweet Potato Polyphenol Oxidase cDNA |
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Abstract: | |
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Keywords: | cDNA |
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