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河南粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析
引用本文:韩迎春,李俊周,郭敏杰,赵全志.河南粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析[J].农业生物技术学报,2012,20(12):1378-1389.
作者姓名:韩迎春  李俊周  郭敏杰  赵全志
作者单位:河南农业大学粮食作物生理生态与遗传改良国家重点实验室培育基地,郑州,450002
基金项目:河南省高校科技创新团队支持计划项目,国家农业科技成果转化,河南省重大公益性科研招标项目
摘    要:为了建立河南粳稻品种的DNA指纹图谱,了解河南粳稻种植品种的遗传多样性,本研究利用均匀分布于水稻(Oryza sativaL.)12条染色体的37对SSR引物,以河南1963~2010年间主要推广种植的37个粳稻(O.sativaL.ssp.japonica)品种为材料,进行简单序列重复(SSR)指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,33对引物具有特异多态性片段,共检测到114个等位基因,平均每位点3.53个等位基因;引物多态性频率为0.054~0.739。37个品种的遗传相似系数为0.627~0.992,平均为0.812。17个品种都至少具有1对SSR特征引物,其余20个品种的鉴定需要结合不同的SSR引物。利用19对核心SSR引物构建的指纹图谱能逐一区分出36个粳稻品种。采用非加权类平均法(UPGMA)进行聚类分析,在遗传相似系数0.710处可将37个品种分为2大类,河南选育品种基本都聚到同一大类群,表明河南推广的粳稻品种遗传基础狭窄。

关 键 词:粳稻  指纹图谱  遗传多样性

Establishment of SSR Fingerprint Map and Analysis of Genetic Similarity among the japonica Rice (Oryza sativa L.) of Henan
HAN Ying-Chun , LI Jun-Zhou , GUO Min-Jie , ZHAO Quan-Zhi.Establishment of SSR Fingerprint Map and Analysis of Genetic Similarity among the japonica Rice (Oryza sativa L.) of Henan[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2012,20(12):1378-1389.
Authors:HAN Ying-Chun  LI Jun-Zhou  GUO Min-Jie  ZHAO Quan-Zhi
Institution:HAN Ying-Chun LI Jun-Zhou* GUO Min-Jie ZHAO Quan-Zhi* Henan Agricultural University, Key Laboratory of Physiology, Ecology and Genetic Improvement of Food Crops in Henan Province, Zhengzhou 450002, China
Abstract:
Keywords:
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