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可可核心种质遗传多样性及果实性状与SSR标记关联分析
引用本文:李付鹏,秦晓威,郝朝运,闫林,伍宝朵,赖剑雄.可可核心种质遗传多样性及果实性状与SSR标记关联分析[J].热带作物学报,2016,37(2):226-233.
作者姓名:李付鹏  秦晓威  郝朝运  闫林  伍宝朵  赖剑雄
作者单位:中国热带农业科学院香料饮料研究所,海南万宁 571533;农业部热带香料饮料作物种质资源圃,海南万宁 571533;农业部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室,海南万宁 571533
基金项目:海南省自然科学基金项目(No. 20153153)。
摘    要:利用15对SSR引物,分析具有广泛来源的70份可可资源的遗传多样性。结果表明,15对引物共扩增出76个条带,其中50个多态性条带,占总带数的65.8%。70份可可资源间遗传相似系数(SM)在0.341~0.943之间,平均值为0.625,说明可可资源具有丰富的遗传多样性。在相似系数为0.65水平上,可将70份可可资源分成10类。利用Structure 2.3.2软件分析群体结构,结合可可果实相关性状的表型数据,采用Tassel 2.1的一般线性模型(General linear model,GLM)进行关联分析;结果表明18个位点与果重、果壳重、果长、果径围、果壳厚显著相关(p0.05),各位点对表型变异贡献率为5.5%~13.1%。

关 键 词:可可  SSR  遗传多样性  关联分析

Genetic Diversity and Association Analysis of Cacao Germplasm Using SSR Markers
LI Fupeng,QIN Xiaowei,HAO Chaoyun,YAN Lin,WU Baoduo and LAI Jianxiong.Genetic Diversity and Association Analysis of Cacao Germplasm Using SSR Markers[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2016,37(2):226-233.
Authors:LI Fupeng  QIN Xiaowei  HAO Chaoyun  YAN Lin  WU Baoduo and LAI Jianxiong
Abstract:
Keywords:Theobroma cacao L    SSR marker  Genetic diversity  Associate analysis
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