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大白菜SSR检测体系的优化
引用本文:石磊,李丽,郑晓鹰.大白菜SSR检测体系的优化[J].分子植物育种,2007,5(1):110-116.
作者姓名:石磊  李丽  郑晓鹰
作者单位:1. 甘肃农业大学草业学院,兰州,730070
2. 北京市农林科学院蔬菜研究中心,北京,100097
摘    要:以不同地区栽培的5份大白菜品种为试材,从PCR反应组成、扩增程序、电泳检测等环节对SSR技术进行了优化,建立了一套适用于大白菜品种鉴定的SSR-PCR体系.即10 μL反应组成为:1×buffer;2.50 mmol/L MgCl2;0.10 mmol/L dNTPs;0.35 μmol/L SSR引物;1.00 ng/μL模板DNA和0.40 U Taq酶.适宜的扩增程序为72℃热启动3 min,94℃预变性2 min后进行20个迫降循环:94℃变性60 s,68℃退火60 s,72℃延伸45 s(-1℃ /2 cycles);再进行20个循环:94℃变性60 s,58℃退火60 s,72℃延伸45 s,72℃延伸10 min.应用SDS-聚丙烯酰胺凝胶(银染)电泳检测并取得很好的效果.选用108对芸薹属SSR引物,对这5份品种的基因组进行扩增,筛选出具有2条以上特异扩增条带的SSR引物22对.用这些引物对5份品种进行扩增,初步分析了SSR标记的多态性及用于大白菜指纹分析的潜力.

关 键 词:大白菜  SSR  检测体系  优化  SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳

Optimization of SSR-PCR System for Identification in Chinese Cabbage(Brassica campestris L. ssp. pekinensis)
Shi Lei,Li Li,Zheng Xiaoying.Optimization of SSR-PCR System for Identification in Chinese Cabbage(Brassica campestris L. ssp. pekinensis)[J].Molecular Plant Breeding,2007,5(1):110-116.
Authors:Shi Lei  Li Li  Zheng Xiaoying
Abstract:
Keywords:Chinese cabbage (Brassica campestris L  ssp  pekinensis)  SSR  Optimization of SSR-PCR system  SDS-polyacrylamide gel electrophoresis
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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