云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织转录组水平的比较分析 |
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引用本文: | 任宇,丁玥竹,农燕鸿,郭爱伟,刘莉莉.云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织转录组水平的比较分析[J].畜牧兽医学报,2022,53(1):43-52. |
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作者姓名: | 任宇 丁玥竹 农燕鸿 郭爱伟 刘莉莉 |
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作者单位: | 西南林业大学生命科学学院, 昆明 650224 |
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基金项目: | 云南省科技厅基础研究青年项目(2019FD06);国家自然科学基金项目(31902152);云南省教育厅科学研究基金项目(2018 JS333)。 |
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摘 要: | 旨在利用RNA-seq技术筛选和分析云南独龙鸡和白来航鸡卵巢组织的差异表达基因,为独龙鸡后续基因功能、品种改良和种质特性等研究奠定基础。本研究采集了3只43周龄健康状况良好的独龙鸡卵巢组织进行转录组测序,并与相似饲养条件和周龄的白来航鸡卵巢组织进行比较。结果表明,与白来航鸡相比,独龙鸡中共有1 273个差异表达基因,其中上调基因522个,下调基因751个。GO和KEGG富集分析显示,差异表达基因主要参与蛋白水解、翻译、细胞外泌体、膜组分、结合和催化等过程,在蛋白合成、ECM-受体相互作用、氧化磷酸化、粘着斑等通路中起到重要作用。对显著性通路分析发现独龙鸡在蛋品质和免疫抗性上具有一定优势,但在产蛋性能上与白来航鸡还存在一定差距。本研究筛选到的RPL22、ATP5I、COX5A、JAKMIP1、CATH2基因主要富集在抗性、产蛋性能和蛋品质相关通路中,可作为重要候选基因进一步深入研究。
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关 键 词: | 独龙鸡 白来航鸡 卵巢组织 转录组测序 差异表达基因 |
收稿时间: | 2021-05-26 |
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