低亚氨基在胶原异源三聚体中倾向性的测定 |
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引用本文: | 刘晗,郑虹宁,张瑞雪,许菲.低亚氨基在胶原异源三聚体中倾向性的测定[J].华中农业大学学报,2020,39(3):105-112. |
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作者姓名: | 刘晗 郑虹宁 张瑞雪 许菲 |
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作者单位: | 江南大学生物工程学院/糖化学与生物技术教育部重点实验室,无锡 214122;江南大学生物工程学院/糖化学与生物技术教育部重点实验室,无锡 214122;江南大学生物工程学院/糖化学与生物技术教育部重点实验室,无锡 214122;江南大学生物工程学院/糖化学与生物技术教育部重点实验室,无锡 214122 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(51603089; 21603088) |
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摘 要: | 为解析不同类型氨基酸残基对天然胶原热稳定性的影响,以更贴近天然胶原序列中低亚氨基的异源三聚体abc为研究主体,设计不同的突变胶原序列,以圆二色谱法测定不同氨基酸对胶原热稳定性的影响,即倾向性。同时统计了天然胶原序列中各氨基酸的出现频率,并基于氨基酸倾向性计算预测了天然Ⅰ型胶原蛋白的局部热稳定性值。结果显示:X位的Ala、Leu和Glu、以及Y位的Gln、Thr、Ala和Arg既具有较高的倾向性,又具有较高的出现频率;天然Ⅰ型胶原蛋白序列可分为2种类型的区域:一种是可促进二级结构形成的高稳定性区域:另一种是对某些生命过程起到关键作用的低稳定性区域;同时具备高热稳定性和高出现频率的氨基酸,对天然胶原蛋白的稳定性起到关键作用。
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关 键 词: | 胶原蛋白 氨基酸倾向性 胶原异源三聚体 主-客体模型 稳定性预测 圆二色谱 低亚氨基序列 发生频率 |
收稿时间: | 2019/9/6 0:00:00 |
Amino acid propensity measured in a low-imino heterotimeric collagen host |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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