| 基于RNA-Seq技术的京海黄鸡卵巢组织转录本预测及新基因挖掘 |
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| 引用本文： | 董新龙,张向前,韩昆鹏,凌姣姣,张跟喜,王金玉,王永娟.基于RNA-Seq技术的京海黄鸡卵巢组织转录本预测及新基因挖掘[J].中国畜牧兽医,2017,44(2):497-504. |
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| 作者姓名： | 董新龙 张向前 韩昆鹏 凌姣姣 张跟喜 王金玉 王永娟 |
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| 作者单位： | 1. 扬州大学动物科学与技术学院, 扬州 225009;
2. 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室, 扬州 225009;
3. 江苏京海集团, 南通 226103 |
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| 基金项目： | 国家肉鸡产业技术体系（nycytx-42-G1-05）；江苏高校优势学科建设工程；江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室 |
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| 摘 要： | 鸡及许多物种的全基因组测序及相关基因图谱都已宣告完成，但由于注释方法的局限性，还存在许多遗漏的新基因及对现有基因的误差注释。RNA-Seq技术是基于第2代测序技术的转录组学研究方法，该研究利用高通量测序技术对8只（高产组4只、低产组4只）300日龄体重一致、饲养条件相同、产蛋数存在差异的京海黄鸡的卵巢组织所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序，通过分析RNA-Seq获得的京海黄鸡卵巢组织转录组数据，共发现4 431个新转录本，并将所有新转录本与GO、NR、Swiss-Prot、KEGG数据库进行比对和分析，发现了很多潜在的新基因并进行功能注释，为鸡基因组的进一步完善及功能基因的挖掘提供了数据基础。
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| 关 键 词： | 转录组测序 京海黄鸡 新转录本 新基因 功能注释 |
| 收稿时间： | 2016-08-02 |
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