| 谷子MRP蛋白家族序列特征、分子进化及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 高豪,满夏夏,孙朝霞,韩渊怀,李红英,侯思宇,郭数进.谷子MRP蛋白家族序列特征、分子进化及表达模式分析[J].农学学报,2021,11(5):74-82. |
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| 作者姓名： | 高豪 满夏夏 孙朝霞 韩渊怀 李红英 侯思宇 郭数进 |
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| 作者单位： | 山西农业大学农学院,山西太谷 030801 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划“杂粮作物品质性状形成分子机理及调控途径”(2018YFD1000705-2);山西省高等学校科学研究优秀成果培育项目“小米特色功能营养成分形成机制”(2019KJ020);山西省重点研发项目“谷子杂种优势利用及基于全基因组SNP的技术开发”(201703D211008);山西农谷项目“山西省主要功能作物产业技术研究与示范-功能作物种质创新研究”(SXNGJSKYZX201702);山西省粮食局攻关项目“特色品质谷子品种筛选”(201803);山西省重点研发计划项目“高产富硒大豆新品系选育”(201803D221008-2);山西农业大学博士科研启动项目“山西不同生态型大豆抗旱应答机制的研究”(2015ZZ07);山西省研究生优秀创新项目“谷子叶酸富集性状全基因组关联分析”(2020SY207) |
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| 摘 要： | 本研究旨在深入了解谷子叶酸转运家族成员的基因结构和表达模式,为谷子体内叶酸转运分子机制的研究奠定基础。使用Phytozome、Clustal X、MEGA7.0等在线工具和软件,对谷子MRP家族成员进行生物信息学分析;基于谷子谷穗有参转录组测序数据,分析谷子MRP家族成员表达模式。结果显示,谷子MRP蛋白家族成员共21个,在7号染色体分布最多,有8个基因;17个谷子MRP蛋白偏碱性和4个偏酸性,根据疏水值判断其均为亲水性蛋白;成员SiMRP7、SiMRP12基因的表达量与谷子组织中的总叶酸含量表现出协同降低的趋势,推测这两个蛋白可能对谷子叶酸的积累起到调控作用。本研究有助于进一步鉴定叶酸转运相关蛋白,为后续研究叶酸代谢途径及谷子基因挖掘提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 谷子 MRP蛋白家族 谷子叶酸 生物信息学分析 表达模式 |
| 收稿时间： | 2020-04-09 |
MRP Protein Family of Foxtail Millet: Analysis of Sequence Characteristics,Molecular Evolution and Expression Pattern |
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| Gao Hao,Man Xiaxia,Sun Zhaoxia,Han Yuanhuai,Li Hongying,Hou Siyu,Guo Shujin.MRP Protein Family of Foxtail Millet: Analysis of Sequence Characteristics,Molecular Evolution and Expression Pattern[J].Journal of Agriculture,2021,11(5):74-82. |
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| Authors: | Gao Hao Man Xiaxia Sun Zhaoxia Han Yuanhuai Li Hongying Hou Siyu Guo Shujin |
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| Institution: | College of Agriculture, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Foxtail Millet MRP Protein Family Folate of Foxtail Millet Bioinformatics Analysis Expression Pattern |
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