首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析
引用本文:张潇峮,徐亘博,廖小林,张家波,陈松林. 牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析[J]. 水产学报, 2011, 35(7): 961-968. DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17330
作者姓名:张潇峮  徐亘博  廖小林  张家波  陈松林
作者单位:1. 华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东,青岛,266071
2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东,青岛,266071
3. 华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070
基金项目:国家“九七三”项目(2010CB126303);国家自然科学基金项目(30871918);山东省农业种质资源项目资助
摘    要:将牙鲆基因组DNA经限制性内切酶RsaⅠ和BstUI双酶切后采用FIASCO法构建酶切片段基因组文库。共挑取269个克隆,177个为阳性克隆,阳性克隆率为65.79%。经测序后获得191条微卫星序列,其中完美型占74.35%;非完美型占14.66%;混合型占10.99%。用引物设计软件Primer Premier 5.0设计引物153对,挑选其中的50对合成并在32个野生牙鲆个体中进行扩增,共31个位点具有多态性,统计结果后使用POPGENE软件进行分析,平均等位基因个数为3.939 4,平均有效等位基因数为3.052 2,平均观测杂合度为0.650 1,平均期望杂合度为0.586 6,各引物的Hardy-Weinberg平衡指数在0.012 587~0.984 917变动。这些筛选出的多态性微卫星标记可应用于进一步的牙鲆遗传多样性分析、家系分析及遗传图谱的构建等工作中。

关 键 词:牙鲆   微卫星   FIASCO   多态性
收稿时间:2011-01-10
修稿时间:2011-04-23

Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in olive flounder(Paralichthys olivaceus)
ZHANG Xiao-jun,XU Gen-bo,LIAO Xiao-lin,ZHANG Jia-bo and CHEN Song-lin. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in olive flounder(Paralichthys olivaceus)[J]. Journal of Fisheries of China, 2011, 35(7): 961-968. DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17330
Authors:ZHANG Xiao-jun  XU Gen-bo  LIAO Xiao-lin  ZHANG Jia-bo  CHEN Song-lin
Affiliation:Huazhong Agricultural University,Yellow Sea Fisheries Research Institute Chinese Academy of Fishery Sciences
Abstract:Olive flounder(Paralichthys olivaceus)is one of economically important fish in China.It is distributed widely over the Bohai Sea,the Yellow Sea and the South Sea in China,North Korea,Japan and along the east coastline of Russia.As its natural resource is exhausting gradually,olive flounder has become an important cultured fish in China.Polymorphic available DNA markers are needed for its genetic research.Microsatellites recently have become an extremely popular marker in a wide variety of genetic investigat...
Keywords:Paralichthys olivaceus   microsatellite   FIASCO   polymorphism
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
点击此处可从《水产学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《水产学报》下载全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号