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基于KEGG千针万线草光合代谢通路分析
引用本文:周灵,王晓丽,曹子林,敖艳婷,姚晓蝶.基于KEGG千针万线草光合代谢通路分析[J].现代农业科技,2023(4):57-61.
作者姓名:周灵  王晓丽  曹子林  敖艳婷  姚晓蝶
作者单位:西南林业大学,西南林业大学,西南林业大学,西南林业大学,西南林业大学
摘    要:千针万线草是一种药用植物,光合作用是植物最基本的代谢途径。本研究通过千针万线草种子转录组测序及功能注释,分析KEGG数据库注释功能并挖掘光合代谢通路基因。结果表明:比对到KEGG中的6 262条Unigenes被归类为6个类别,其中注释到代谢相关通路的Unigene数量最多,有3 051条,占比48.72%;同时,在代谢通路中千针万线草光合代谢通路涉及光合作用、光合作用-天线蛋白和碳同化3个代谢途径,其中光合作用途径涉及光系统Ⅰ反应中心亚基1个、5种光系统Ⅱ蛋白、1种细胞色素b6复合物、2种细胞色素b6-f亚基、1种铁氧化还原蛋白、1种铁氧还蛋白-NADP+还原酶、5种F-型H+-ATP酶亚基,光合作用-天线蛋白途径包括2种光系统Ⅱ结合蛋白,碳同化途径包括卡尔文循环、C4、景天酸代谢3个途径,分别涉及12种、12种、5种酶。本研究为开展光合作用分子机制研究奠定了基础。

关 键 词:千针万线草  种子  转录组测序  KEGG注释  光合代谢
收稿时间:2022/5/13 0:00:00
修稿时间:2022/5/13 0:00:00

Analysis of photosynthetic metabolic pathway of Stellaria yunnanensis
Abstract:
Keywords:
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