基于KEGG千针万线草光合代谢通路分析 |
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引用本文: | 周灵,王晓丽,曹子林,敖艳婷,姚晓蝶.基于KEGG千针万线草光合代谢通路分析[J].现代农业科技,2023(4):57-61. |
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作者姓名: | 周灵 王晓丽 曹子林 敖艳婷 姚晓蝶 |
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作者单位: | 西南林业大学,西南林业大学,西南林业大学,西南林业大学,西南林业大学 |
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摘 要: | 千针万线草是一种药用植物,光合作用是植物最基本的代谢途径。本研究通过千针万线草种子转录组测序及功能注释,分析KEGG数据库注释功能并挖掘光合代谢通路基因。结果表明:比对到KEGG中的6 262条Unigenes被归类为6个类别,其中注释到代谢相关通路的Unigene数量最多,有3 051条,占比48.72%;同时,在代谢通路中千针万线草光合代谢通路涉及光合作用、光合作用-天线蛋白和碳同化3个代谢途径,其中光合作用途径涉及光系统Ⅰ反应中心亚基1个、5种光系统Ⅱ蛋白、1种细胞色素b6复合物、2种细胞色素b6-f亚基、1种铁氧化还原蛋白、1种铁氧还蛋白-NADP+还原酶、5种F-型H+-ATP酶亚基,光合作用-天线蛋白途径包括2种光系统Ⅱ结合蛋白,碳同化途径包括卡尔文循环、C4、景天酸代谢3个途径,分别涉及12种、12种、5种酶。本研究为开展光合作用分子机制研究奠定了基础。
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关 键 词: | 千针万线草 种子 转录组测序 KEGG注释 光合代谢 |
收稿时间: | 2022/5/13 0:00:00 |
修稿时间: | 2022/5/13 0:00:00 |
Analysis of photosynthetic metabolic pathway of Stellaria yunnanensis |
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