玉米大斑病菌Velvet基因家族生物信息学分析 |
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引用本文: | 杨峥,申珅,李贞杨,董金皋. 玉米大斑病菌Velvet基因家族生物信息学分析[J]. 河北农业大学学报, 2016, 0(5): 18-25. DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2016.0102 |
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作者姓名: | 杨峥 申珅 李贞杨 董金皋 |
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作者单位: | 河北农业大学生命科学学院,河北保定,071001 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31301616),河北省自然科学基金(2014204111) |
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摘 要: | 采用生物信息学方法对玉米大斑病菌Velvet基因家族成员进行序列鉴定,并从理化性质、保守结构域、二级及三级结构以及功能域等方面进行预测和分析。结果表明,该家族各成员无信号肽结构。玉米大斑病菌Velvet家族基因与其他植物病原真菌Velvet家族基因具有较高同源性。该家族成员具有典型的Velvet超家族保守结构域。二级结构分析结果显示,该家族各成员蛋白质的结构元件均主要由无规则卷曲构成。家族成员可能通过可逆磷酸化在植物病原真菌的次生代谢中发挥作用。上述结果为进一步研究Velvet基因家族在植物病原真菌次生代谢中的作用打下了基础。
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关 键 词: | 玉米大斑病菌 Velvet基因家族 生物信息学 结构域 |
Bioinformatic analysis of Velvet gene family in Setospharia turcica |
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Abstract: | |
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Keywords: | Setosphaeria turcica Velvet gene family bioinformatics domain |
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