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| 斑点叉尾(鮰)源海豚链球菌DGX07株simA基因克隆、鉴定及分子特性分析 | |
| 引用本文： | 汪开毓,王均,肖丹,陈德芳,黄锦炉,黄凌远,付希,王浩丞. 斑点叉尾(鮰)源海豚链球菌DGX07株simA基因克隆、鉴定及分子特性分析[J]. 水产学报, 2012, 36(3) |
| 作者姓名： | 汪开毓 王均 肖丹 陈德芳 黄锦炉 黄凌远 付希 王浩丞 |
| 作者单位： | 1. 四川农业大学鱼病研究中心,四川雅安625014;四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014 2. 通威股份有限公司,四川成都,610041 |
| 摘 要： | 以Primer p14(5’-GATCAAGTCC-3’)为引物对分离自患病斑点叉尾(鮰)海豚链球菌强毒株DGX07进行RAPD分析.同时参照GenBank中海豚链球菌simA基因序列设计特异性引物,以DGX07基因组DNA为模板,扩增出约1 500 bp的simA基因,并将其克隆到pMD19-T载体上,之后对重组质粒进行PCR和双酶切(BamH Ⅰ+Xho Ⅰ)鉴定,鉴定正确后送测序公司测序.RAPD分析结果显示,DGX07和标准菌株均能扩增出750 bp大小的条带.通过生物信息学软件对测序结果分析显示,simA基因全长1 566bp,由521个氨基酸组成,与海豚链球菌simA和simB亲缘性达100％,存在1个由41个氨基酸组成的信号肽,具有Bap31和Gram_pos_anchor两个超家族的保守结构域；具有与蛋白翻译后修饰功能相关的磷酸化位点22个和N-糖基化位点2个,编码多肽链中亲水区大于疏水区,是一种膜外蛋白,并具有多个抗原优势位点区域.密码子偏爱性分析表明,斑点叉尾(鮰)源海豚链球菌simA基因密码子使用频率差异较大,密码子偏爱性与酵母较为接近.获得GenBank登录号为JF330100. |
| 关 键 词： | 斑点叉尾(鮰) 海豚链球菌 simA基因 克隆 |
Cloning,identification and molecular characteristics analysis of simA gene of a Streptococcus iniae strain DGX07 from channel catfish |
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| WANG Kai-yu , WANG Jun , XIAO Dan , CHENG De-fang , HUANG Jin-lu , HUANG Ling-yuan , FU Xi , WANG Hao-cheng. Cloning,identification and molecular characteristics analysis of simA gene of a Streptococcus iniae strain DGX07 from channel catfish[J]. Journal of Fisheries of China, 2012, 36(3) | |
| Authors: | WANG Kai-yu WANG Jun XIAO Dan CHENG De-fang HUANG Jin-lu HUANG Ling-yuan FU Xi WANG Hao-cheng |
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