豚鼠ESR2基因新的可变剪接体克隆及序列分析 |
| |
引用本文: | 司景磊,李龙,陈秋明,郭晓萍,郭亚芬,蒋钦杨.豚鼠ESR2基因新的可变剪接体克隆及序列分析[J].南方农业学报,2016(5):731-735. |
| |
作者姓名: | 司景磊 李龙 陈秋明 郭晓萍 郭亚芬 蒋钦杨 |
| |
作者单位: | 广西大学动物科学技术学院,南宁,530005 |
| |
基金项目: | 南宁市科学研究与技术开发计划项目(20132099) |
| |
摘 要: | 【目的】对豚鼠雌激素受体2(ESR2)基因进行克隆及序列分析,并预测分析其编码的蛋白序列,为提高豚鼠产仔性能及其育种打下基础。【方法】根据Gen Bank已公布的豚鼠ESR2基因序列(登录号XM_003472337)设计引物,以豚鼠卵巢组织总RNA为模板,RT-PCR扩增ESR2基因编码区序列(CDS),利用生物信息学分析其编码蛋白氨基酸的组成及理化性质、二级结构及与相关物种的同源性。【结果】克隆获得的豚鼠ESR2基因CDS长度为1650 bp,编码549个氨基酸,比参照序列(XM_003472337)少54个碱基,是ESR2基因新的可变剪接体,且第7外显子缺失;蛋白质二级结构预测结果表明,豚鼠ESR2成熟肽包含α螺旋、β折叠和无规卷曲3种二级结构元件,由于缺失18个氨基酸导致蛋白质结构发生变异;同源性分析结果显示,豚鼠与长尾龙猫、奥氏更格卢鼠、马、达马拉鼹鼠、裸鼢鼠、鼠狐猴、八齿鼠、猪和人的ESR2基因序列同源性分别为91%、87%、86%、91%、92%、86%、88%、92%和86%。【结论】克隆获得的豚鼠ESR2基因为新的可变剪接体,可作为研究豚鼠产仔性能及豚鼠育种重要的候选基因之一。
|
关 键 词: | 豚鼠 产仔性能 ESR2基因 克隆 序列分析 |
Cloning and sequencing for new alternative splicing of ESR2 gene in Cavia porcellus |
| |
Abstract: | |
| |
Keywords: | Cavia porcellus farrowing performance ESR2 gene clone sequence analysis |
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录! |
|