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传染性法氏囊病病毒浙江分离株(ZJ2000)基因组A节段全长cDNA的克隆和序列分析
引用本文:李建荣,于涟,黄耀伟,宋厚辉,郑筱祥.传染性法氏囊病病毒浙江分离株(ZJ2000)基因组A节段全长cDNA的克隆和序列分析[J].中国兽医学报,2002,22(1):10-14.
作者姓名:李建荣  于涟  黄耀伟  宋厚辉  郑筱祥
作者单位:1. 浙江大学动物预防医学研究所,浙江,杭州,310029;浙江大学生物医学工程研究所,浙江,杭州,310027
2. 浙江大学动物预防医学研究所,浙江,杭州,310029
3. 浙江大学生物医学工程研究所,浙江,杭州,310027
基金项目:国家“8 63”高科技资助项目 (No.10 1-j99-0 2 )
摘    要:以传染性法氏囊病病毒(IBDV)浙江分离株(ZJ2000)基因组RNA为模板,采用Long-accurate RT-PCR(LA-PCR)一步法扩增并克隆了IBDV ZJ2000株基因组A节段全长cDNA。序列测定结果表明,克隆的A节段全长共3259个核苷酸,包括5'、3'端的非编码区(NCRs)和2个部分重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2),与参比的血清1型毒株核苷酸序列的同源性高达95.2%-99.2%。二级结构预测表明,在5'-NCRs存在1个大型的茎环发夹结构。ORF2编码145个氨基酸的VP5,与参比毒株的同源性高达98.6%-100%。ORF1编码1012个氨基酸的VP2/VP4/VP3,在氨基酸水平上VP2、VP3、VP4与参比毒株的同源性分别达到94.9%-98.8、96.1%-98.5%、97.1%-99.2%。ZJ2000共有14-38氨基酸的替代,其中特有氨基酸6个,变异大多数集中在VP2高变区,突变率达2.9%-11%。第2个小亲水区内280位氨基酸由S替代了N、290位M替代了L。这2个突变可能与IBDV的抗原性有关。VP2-VP4剪切位点附近511和540位氨基酸的变异可能使ZJ2000株的毒力增强。分子系统进化树分析表明,ZJ2000与欧洲Cu-1株、P2株、CEF94株和中国Harbin株的有关最近,而与欧洲、香港、日本的超强毒株和美国的变异株相对较远。

关 键 词:传染性法氏囊病病毒  基因组A节段全长cDNA  克隆  序列分析
文章编号:1005-4545(2002)01-0010-05
修稿时间:2001年2月4日

Cloning and Sequence Analysis of Full-length Segment A of an Infectious Bursal Disease Virus(Z J2000) Isolated in Zhejiang Province
Abstract:
Keywords:infectious bursal disease virus(IBDV)  full  length segment A  cloning  sequence analysis
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