传染性法氏囊病病毒浙江分离株(ZJ2000)基因组A节段全长cDNA的克隆和序列分析 |
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引用本文: | 李建荣,于涟,黄耀伟,宋厚辉,郑筱祥.传染性法氏囊病病毒浙江分离株(ZJ2000)基因组A节段全长cDNA的克隆和序列分析[J].中国兽医学报,2002,22(1):10-14. |
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作者姓名: | 李建荣 于涟 黄耀伟 宋厚辉 郑筱祥 |
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作者单位: | 1. 浙江大学动物预防医学研究所,浙江,杭州,310029;浙江大学生物医学工程研究所,浙江,杭州,310027 2. 浙江大学动物预防医学研究所,浙江,杭州,310029 3. 浙江大学生物医学工程研究所,浙江,杭州,310027 |
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基金项目: | 国家“8 63”高科技资助项目 (No.10 1-j99-0 2 ) |
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摘 要: | 以传染性法氏囊病病毒(IBDV)浙江分离株(ZJ2000)基因组RNA为模板,采用Long-accurate RT-PCR(LA-PCR)一步法扩增并克隆了IBDV ZJ2000株基因组A节段全长cDNA。序列测定结果表明,克隆的A节段全长共3259个核苷酸,包括5'、3'端的非编码区(NCRs)和2个部分重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2),与参比的血清1型毒株核苷酸序列的同源性高达95.2%-99.2%。二级结构预测表明,在5'-NCRs存在1个大型的茎环发夹结构。ORF2编码145个氨基酸的VP5,与参比毒株的同源性高达98.6%-100%。ORF1编码1012个氨基酸的VP2/VP4/VP3,在氨基酸水平上VP2、VP3、VP4与参比毒株的同源性分别达到94.9%-98.8、96.1%-98.5%、97.1%-99.2%。ZJ2000共有14-38氨基酸的替代,其中特有氨基酸6个,变异大多数集中在VP2高变区,突变率达2.9%-11%。第2个小亲水区内280位氨基酸由S替代了N、290位M替代了L。这2个突变可能与IBDV的抗原性有关。VP2-VP4剪切位点附近511和540位氨基酸的变异可能使ZJ2000株的毒力增强。分子系统进化树分析表明,ZJ2000与欧洲Cu-1株、P2株、CEF94株和中国Harbin株的有关最近,而与欧洲、香港、日本的超强毒株和美国的变异株相对较远。
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关 键 词: | 传染性法氏囊病病毒 基因组A节段全长cDNA 克隆 序列分析 |
文章编号: | 1005-4545(2002)01-0010-05 |
修稿时间: | 2001年2月4日 |
Cloning and Sequence Analysis of Full-length Segment A of an Infectious Bursal Disease Virus(Z J2000) Isolated in Zhejiang Province |
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Abstract: | |
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Keywords: | infectious bursal disease virus(IBDV) full length segment A cloning sequence analysis |
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