玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析 |
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作者姓名: | 练冬梅 赖正锋 姚运法 张少平 林碧珍 洪建基 |
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作者单位: | 福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005;福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005;福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005;福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005;福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005;福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005 |
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基金项目: | 国家麻类产业技术体系专项 |
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摘 要: | 以玫瑰茄(Hibiscus sabdariffa Linnaeus)花瓣和花萼为研究对象,采用Illumina Hiseq~(TM) 2500高通量测序技术,对花瓣和花萼进行转录组测序及花青素合成相关基因差异表达分析。结果表明,花瓣和花萼共获得13.94 Gb有效数据(clean data),Q30碱基百分比均达到93.0%以上;共获得1 399个差异表达基因(DEGs),包括65个上调基因,1 334个下调基因,且功能注释的基因有1 176个;筛选出了与花青素合成相关结构基因CHI、FLS、ANR、CHI在花萼中表达显著,FLS、ANR在花瓣中表达显著。本研究丰富了花青素相关研究,可为阐明玫瑰茄花青素合成机制提供理论依据。
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关 键 词: | 玫瑰茄 花瓣 花萼 转录组 花青素 差异表达基因 |
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