贵州本地山羊STAT5A基因第10外显子SNP研究 |
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引用本文: | 谢海强,孙岩岩,盘道兴,钱成,康建兵,胡玲玲,龚俞,焦仁刚,刘若余.贵州本地山羊STAT5A基因第10外显子SNP研究[J].江苏农业科学,2015(7). |
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作者姓名: | 谢海强 孙岩岩 盘道兴 钱成 康建兵 胡玲玲 龚俞 焦仁刚 刘若余 |
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作者单位: | 1. 贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳,550025 2. 贵州省畜牧技术推广站,贵州贵阳,550001 |
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基金项目: | 贵州省重大科技专项计划(编号黔科合重大专项字[2011]6009号);黔西南州种草养羊产业发展省州科技合作专项(编号黔西南科合字[2011]5-3号);贵州大学研究生创新基金(编号研农2014012)。 |
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摘 要: | 利用黔北麻羊、贵州黑山羊和贵州白山羊构建DNA池,设计1对引物扩增其STAT5A基因第10外显子及部分内含子序列。PCR产物纯化后进行双向测序。DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构、STAT5A蛋白二级及三级结构的影响。结果表明:在扩增的STAT5A基因中筛选到3个SNPs:C-32A、G+71A和G+158A,其中G+71A为错义突变,导致编码的丙氨酸(Ala)变为苏氨酸(Thr);C-32A和G+158A均在内含子区,不参与氨基酸编码。SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构和STAT5A蛋白结构均有一定影响。
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关 键 词: | STAT5A 基因 SNPs 外显子 贵州本地山羊 |
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