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| 绵羊HADHB基因生物信息学分析及营养应激状态下的表达变化 | |
| 作者姓名： | 郭丽荣 韩高链 张枫惠 李俊玲 秦健 杜荣 |
| 作者单位： | 1.山西农业大学动物科技学院;2.山西农业大学实验教学中心;3.山西农业大学生命科学学院 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(31872438;31272527);山西省回国留学人员科研资助项目(2016-067);山西省留学回国人员科技活动择优资助项目;山西省平台基地和人才专项优秀人才科技创新项目(201605D211028);山西省重点研发计划项目(201803D221022-4);山西农业大学中青年拔尖创新人才支持计划(BJRC201204);山西农业大学横向科技项目(2015HX12) |
| 摘 要： | 本研究旨在探索绵羊HADHB的分子特性以及在营养应激中的作用。根据GenBank登录的基因序列(XM_004005732.3)对HADHB基因进行一系列生物信息学分析。随机选取6只成年健康绵羊,分为正常组和禁食组。通过荧光定量PCR技术及NormFinder软件检测2个常用内参基因ACTB和GAPDH的稳定性,然后测定HADHB基因的表达。结果表明:绵羊HADHB分子式为C2273H3648N630O673S24,由475个氨基酸组成,存在蛋白质跨膜区,该蛋白有91.3%位于线粒体;HADHB理论等电点(pI)为9.38,平均疏水性为-0.093,不稳定指数为34.16;HADHB基因在不同物种中保守性较高,进化树和三级结构预测结果均表明绵羊和山羊、藏羚羊、牛亲缘关系较近;荧光定量结果表明,ACTB更适合作为本实验的内参基因,禁食组绵羊HADHB基因mRNA表达量较正常组显著上升。本研究成功构建了营养缺陷应激模型,为绵羊HADHB及相关通路的进一步探索奠定了基础。 |
| 关 键 词： | 绵羊 营养应激 HADHB基因 生物信息学分析 MRNA表达 |
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