青花菜花蕾发育LncRNAs内参基因筛选 |
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引用本文: | 裴徐梨,冯鹏宇,唐征,李亚梅,焦鹏,荆赞革.青花菜花蕾发育LncRNAs内参基因筛选[J].河南农业科学,2023(1):125-133. |
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作者姓名: | 裴徐梨 冯鹏宇 唐征 李亚梅 焦鹏 荆赞革 |
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作者单位: | 1. 昆明学院农学与生命科学学院;2. 温州科技职业学院农业与生物技术学院 |
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基金项目: | 浙江省自然科学基金项目(LY18C150006);;浙江省农业(蔬菜新品种选育)新品种选育重大科技专项子项目(2021C02065-4-2);;温州市科技项目(2019ZX007-2); |
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摘 要: | 在分析青花菜花蕾发育过程长链非编码RNA(LncRNAs)的表达中,筛选稳定表达的内参基因至关重要。通过前期高通量测序筛选出16个候选内参基因,利用qRT-PCR技术检测其表达水平,并结合geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个软件对16个LncRNAs在青花菜花蕾不同部位和不同发育时期的表达稳定性进行分析。结果表明,在花蕾不同部位中,geNorm算法认为XLOC_000400、XLOC_008536、XLOC_034059为最适内参基因;NormFinder计算XLOC_021473、XLOC_000400、XLOC_034059为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_025578表达最稳定。在花蕾不同发育时期中,geNorm算法认为XLOC_000108、XLOC_039609、XLOC_021473为最适内参基因;NormFinder计算XLOC_021473、XLOC_039609、XLOC_000108为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_034059表达最稳定。综合评估后,在花蕾不同部位和不同发育时期中适宜的内参基因对分别为XLO...
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关 键 词: | 青花菜 内参基因 长链非编码RNA 花蕾 |
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