玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 康希泉,亓帅,臧德奎,郑林,徐宗大,邢树堂,于晓艳.玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆与生物信息学分析[J].山东林业科技,2019(2):8-11,22. |
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作者姓名: | 康希泉 亓帅 臧德奎 郑林 徐宗大 邢树堂 于晓艳 |
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作者单位: | 胜利油田胜大园林工程有限公司;山东农业大学;青州市花卉产业管理局 |
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基金项目: | 国家自然科学基金青年项目(31200524);国家自然科学基金面上项目(31870688) |
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摘 要: | 为了探明胼胝质对玫瑰授粉亲和性的影响,本研究以‘唐红’玫瑰花柱为试材,采用RT-PCR和RACE方法获得了玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因的cDNA全长,命名为RrCalS。该基因全长5742 bp,开放阅读框5295 bp,编码1764个氨基酸。推导编码蛋白的分子量为204.7kD, PI值为9.00,在164-265位具有pfam14288结构域,在869-1642位具有pfam02364保守结构域,属于葡聚糖合成酶超家族;该蛋白属于疏水性、非分泌型蛋白,具有16个跨膜结构域,含有32个Ser磷酸化位点、21个Thr磷酸化位点、12个Tyr磷酸化位点;该蛋白的α-螺旋占49.49%,无规则卷曲占22.68%,β-转角占7.94%;该蛋白与Fragaria vesca等8种植物的Cals氨基酸序列同源性达73%以上,且它们的系统进化关系与传统分类结果一致。本研究为进一步深入研究玫瑰授粉不亲和机理,提高玫瑰育种理论和技术水平奠定了基础。
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关 键 词: | 玫瑰 β-1 3-葡聚糖合成酶 基因克隆 |
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