| 苹果SUPERMAN类蛋白家族的基因克隆与生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 赵旭勉,任雪芹,张文,李皓,朱元娣.苹果SUPERMAN类蛋白家族的基因克隆与生物信息学分析[J].农业生物技术学报,2012(7):782-790. |
| |
| 作者姓名： | 赵旭勉 任雪芹 张文 李皓 朱元娣 |
| |
| 作者单位： | 中国农业大学农学与生物技术学院果树系 |
| |
| 基金项目： | 国家公益性行业(农业)专项经费(201003021) |
| |
| 摘 要： | SUPERMAN 类基因是植物生长发育中的重要转录因子。为了揭示苹果 SUPERMAN 类蛋白家族的生理基因功能,本研究以富士苹果(Malus domestica Borkh.cv. Fuji)为试材,利用 RT-PCR 方法和锚定PCR 方法克隆了 MdLIFa(GenBank 登录号 HM370493)和启动子序列,利用特异引物 PCR 方法克隆了苹果基因组中其余 11 个 SUPERMAN 类基因。12 个基因命名为 MdLIFa/MdLIFb (GenBank 登录号:HQ260429)、MdSUP1a (HQ418477)/MdSUP1b (HQ418478)、MdSUP4 (HQ418475)/MdSUP12 (HQ418476)、MdSUP5a (HQ418469)/MdSUP13b (HQ418470)、MdSUP9a (HQ418473)/MdSUP9b (HQ418474) 和 MdSUP5b(HQ418471)/MdSUP13a(HQ418472),分别位于 11/3、1/1、4/12、5/13、9/ 未知和 5/13 号染色体,每对基因间的同源性均在86%以上。通过基因枪法轰击洋葱(Allium cepa)表皮细胞,基因瞬时表达证明 MdLIFa 定位于细胞核内。MdLIFa 基因启动子序列中含有多个参与花粉发育、根特异性表达、与光诱导和 Dof 单锌指基因家族作用的调控元件等。系统进化分析表明,MdLIFa/b、MdSUP9a/9b 和 MdSUP5a/13b、以及MdSUP1a/b、MdSUP5b/MdSUP13a和 MdSUP4/12 分别聚类为一组,参与植株的形态建成和花器官发育。苹果 12 个 SUPERMAN 类基因成对高度同源,具有生物学功能的多样性,为深入的基因鉴定和遗传转化提供有用信息。
|
| 关 键 词： | 苹果 SUPERMAN类基因 转录因子 生物信息学 |
Gene Cloning and Bioinformatics Analysis of SUPERMAN Family Proteins in Apple(Malus domestic Borkh.) |
| |
| ZHAO Xu-Mian REN Xue-Qin ZHANG Wen,LI Hao,ZHU Yuan-Di.Gene Cloning and Bioinformatics Analysis of SUPERMAN Family Proteins in Apple(Malus domestic Borkh.)[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2012(7):782-790. |
| |
| Authors: | ZHAO Xu-Mian REN Xue-Qin ZHANG Wen LI Hao ZHU Yuan-Di |
| |
| Institution: | Department of Pomology, College of Agriculture and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
|
