| 草菇Volvariella volvacea中乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因vv-pyrG的克隆和序列分析 |
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| 引用本文： | 牛丽英,鲍大鹏,陈明杰,谭琦.草菇Volvariella volvacea中乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因vv-pyrG的克隆和序列分析[J].上海农业学报,2010,26(1):33-37. |
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| 作者姓名： | 牛丽英 鲍大鹏 陈明杰 谭琦 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学食品学院,上海,201306;国家食用菌工程技术研究中心,农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室,上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所,上海,201106
2. 国家食用菌工程技术研究中心,农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室,上海市农业遗传育种重点开放实验室,上海市农业科学院食用菌研究所,上海,201106 |
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| 基金项目： | 上海市农委科技兴农重点攻关项目，农业部公益性行业科研专项项目，上海市科委基础研究重点项目 |
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| 摘 要： | 运用简并PCR和基因组步行技术克隆常见食用菌草菇的乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因（vv-pyrG基因），并运用生物信息学和系统发育学的方法对所获得的基因进行了序列分析。结果显示：vv-pyrG基因的编码区长度为920bp，含有2个长度分别为65bp和54bp的内含子，可以编码1个含有266个氨基酸残基的蛋白质序列。该氨基酸序列经比对分析，显示与裂褶菌（Schizophyllum commune）和灰盖鬼伞（Coprinus cinereus）的OMPDC序列的相同性分别为58％和64％，相似性分别为74％和78％。对24种真菌的OMPDC氨基酸序列进行系统发育分析表明，系统进化树中草菇与灰盖鬼伞、裂褶菌、双色蜡蘑（Laccaria bicolor）和白腐菌（Phanerochaete sordida）聚在一起，在节点上的支持率是97％。
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| 关 键 词： | 草菇 巢式简并PCR vv-pyrG基因 序列分析 |
Cloning and sequence analysis of the vv-pyrG gene encoding orotidine-5'monophosphate decarboxylase in Volvariella volvacea |
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| NIU Li-ying,BAO Da-peng,CHEN Ming-jie,TAN Qi.Cloning and sequence analysis of the vv-pyrG gene encoding orotidine-5'monophosphate decarboxylase in Volvariella volvacea[J].Acta Agriculturae Shanghai,2010,26(1):33-37. |
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| Authors: | NIU Li-ying BAO Da-peng CHEN Ming-jie TAN Qi |
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| Institution: | NIU Li-ying1,2,BAO Da-peng2,CHEN Ming-jie2,TAN Qi2(1College of Food Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China,2National Engineering Research Center of Edible Fungi,Key Laboratory of Applied MycologicalResources , Utilization,Ministry of Agriculture,Shanghai Key Laboratory of AgriculturalGenetics , Breeding,Institute of Edible Fungi,SAAS,Shanghai 201106,China) |
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| Abstract: | A vv-pyrG gene(920 bp long)encoding orotidine-5'-monophosphate decarboxylase(OMPDC)was cloned from Volvariella volvacea by means of nested degenerate PCR and genomic walking technology.The bioinformatic analysis indicated that the vv-pyrG gene had two introns being respectively 65 bp and 54 bp in length,and could encode a protein sequence containing 266 amino acid residues.The sequence alignment analysis of amino acids revealed that the identity and similarity between the putative amino acid sequence encode... |
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| Keywords: | Volvariella volvacea Nested degenerate PCR vv-pyrG gene Sequence analysis |
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