| 草莓镶脉病毒（SVBV）ORF Ⅵ基因的克隆及蛋白特性分析 |
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| 引用本文： | 李瑞,倪方锐,贾琳,蒋磊,江彤.草莓镶脉病毒（SVBV）ORF Ⅵ基因的克隆及蛋白特性分析[J].西南农业大学学报,2011,33(12). |
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| 作者姓名： | 李瑞 倪方锐 贾琳 蒋磊 江彤 |
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| 作者单位： | 安徽农业大学植物保护学院; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30740033); 安徽省科技厅自然科学基金资助项目(11040606M68); 安徽省教育厅自然科学基金重点资助项目(KJ2009A105,KJ2008A133) |
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| 摘 要： | 用CTAB法从感染草莓镶脉病毒(strawberry vein banding virus,SVBV)的草莓叶片中提取总DNA,设计特异性引物扩增SVBV ORF Ⅵ基因的全长片段,进行克隆并测序.序列分析表明SVBV ORF Ⅵ基因完整序列全长1 557bp,编码518个氨基酸.将其与SVBV美国分离物以及花椰菜花叶病毒属其他成员的ORF Ⅵ基因相比较,结果表明SVBV中国分离物ORF Ⅵ基因与SVBV美国分离物ORF Ⅵ基因核苷酸序列相似性最高,达84.5%;而与花椰菜花叶病毒属其他成员的ORF Ⅵ基因序列相似性均较低,仅为23.7%～27.9%.构建SVBV及其同属其他成员ORF Ⅵ基因的系统关系树,结果显示SVBV中国分离物与SVBV美国分离物单独形成1个分支,说明来源于草莓的2个SVBV亲缘关系最近,而与其同属其他成员的亲缘关系均较远.生物信息学分析表明SVBVORF Ⅵ基因表达的P6蛋白序列含有多种蛋白激酶磷酸化位点,其二级结构N端是1个α-螺旋富集区.该研究将为进一步研究P6蛋白的功能提供理论依据.
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| 关 键 词： | 草莓镶脉病毒 ORF Ⅵ基因 克隆 序列分析 二级结构 |
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