甘蔗水分胁迫响应的δ-鸟氨酸转氨酶基因克隆及分子特征分析 |
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引用本文: | 张积森,陈由强,郭春芳,李伟,阙友雄,叶冰莹,陈如凯,张木清.甘蔗水分胁迫响应的δ-鸟氨酸转氨酶基因克隆及分子特征分析[J].热带作物学报,2009,30(8):1062-1068. |
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作者姓名: | 张积森 陈由强 郭春芳 李伟 阙友雄 叶冰莹 陈如凯 张木清 |
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作者单位: | 1. 福建师范大学生命科学学院,福建,福州,350108农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室,福建,福州,350002 2. 农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室,福建,福州,350002 3. 福建师范大学生命科学学院,福建,福州,350108 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(No. 30370901),国家863计划“高蓄能能源甘蔗新品种的创制与应用”(No. 2007AA100701),国家农业公益性行业科研专项(No. nyhyzx07-019)资助。 |
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摘 要: | 通过消减文库技术,结合cDNA芯片技术筛选到1个明显受水分胁迫诱导的EST序列(Ratio值为8.1),比对分析推测其为δ-OAT基因的片段,进而通过RACE结合PCR技术获得该基因全长cDNA序列为1782bp,其中5′端非编码区150bp,开放阅读框为1362bp,3′端非编码区为270bp且存在2个终止加A信号AATAA。预测其编码的蛋白质分子量为49.5ku,等电点为6.5,为一个跨膜蛋白。序列比对分析结果表明,δ-OAT基因家族N末端和C末端相对不保守,而主要功能区均表现保守。基因进化分析显示,单子叶禾本科植物和双子叶植物鸟氨酸转氨酶编码基因分别由各自祖先进化而来,而微生物的鸟氨酸转氨酶编码基因表现出复杂的进化关系。荧光实时PCR分析δ-OAT在根、茎、叶的表达,该基因在茎的表达较高,其次是叶而后为根,但没有明显的组织表达特异性。本文首次报道甘蔗δ-OAT基因克隆研究结果,为该基因的深入研究和应用奠定一定基础。
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关 键 词: | 甘蔗 水分胁迫 δ-鸟氨酸转氨酶 荧光实时PCR |
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