| 基于蛋白质组学的三角帆蚌珍珠囊形成相关免疫因子研究 |
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| 引用本文： | 李文娟,杨婧漪,冯上乐,李雪男,陈一格,申晓雅,白志毅.基于蛋白质组学的三角帆蚌珍珠囊形成相关免疫因子研究[J].上海海洋大学学报,2022,31(2):344-354. |
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| 作者姓名： | 李文娟 杨婧漪 冯上乐 李雪男 陈一格 申晓雅 白志毅 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心;上海海洋大学 农业部淡水水产种质资源重点实验室,上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海海洋大学 农业部淡水水产种质资源重点实验室 |
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| 基金项目： | 本研究由国家重点研发计划(2018YFD0901406)、“上海市优秀学术带头人计划” (19XD1421500) 资助, 及财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系资助. |
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| 摘 要： | 采用iTRAQ及生物信息分析技术研究三角帆蚌珍珠囊及外套膜外膜组织蛋白组差异,筛选其与珍珠形成和生长进程中的免疫调节因子,并通过数字基因表达谱,分析了外套膜插核进程中免疫相关因子的mRNA表达水平。研究结果表明,1871个蛋白被鉴定到,其中显著性差异表达蛋白119个(P<0.05),包括上调蛋白74个,下调蛋白45个；分析发现差异表达蛋白主要具有结合、催化、结构分子、运载体、调节酶等活性,主要富集于次生代谢、变形虫病、糖酵解与糖异生、近端小管碳酸氢盐回收、心肌病、甲烷代谢、脂肪细胞因子pathway。进一步筛选获得免疫相关蛋白37个(19个上调蛋白和18个下调蛋白),其主要富集于Notch、Hippo、NF-κB、TGF-β等信号通路,参与免疫球蛋白、凋亡、损伤愈合以及炎症反应。对上调蛋白中的MRC1、LBP、EPX、FcGBP以及下调蛋白中的CD109、CNN3、NOTCH3、LAMB2等在外套膜以及插核后5、20 thd的插核组织和50、90 thd的珍珠囊组织中mRNA表达量进行分析验证,表达与蛋白水平表达趋势相同,对后续将进一步关注不同免疫相关蛋白间的相互作用及其潜在关联,为阐述贝类免疫系统调节网络研究提供基础资料。
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| 关 键 词： | 三角帆蚌 珍珠囊 外套膜外膜 免疫相关因子 |
| 收稿时间： | 2021/6/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/7/7 0:00:00 |
Analysis of proteomic differences and immune factors between Hyriopsis cumingii mantle and pearl sac |
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| LI Wenjuan,YANG Jingyi,FENG Shangle,LI Xuenan,CHEN Yige,SHEN Xiaoy,BAI Zhiyi.Analysis of proteomic differences and immune factors between Hyriopsis cumingii mantle and pearl sac[J].Journal of Shanghai Ocean University,2022,31(2):344-354. |
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| Authors: | LI Wenjuan YANG Jingyi FENG Shangle LI Xuenan CHEN Yige SHEN Xiaoy BAI Zhiyi |
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| Institution: | National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education,Shanghai Ocean University;Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources,Ministry of Agriculture,Shanghai Ocean University,National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education,Shanghai Ocean University,National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education,Shanghai Ocean University,National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education,Shanghai Ocean University,National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education,Shanghai Ocean University,National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education,Shanghai Ocean University,Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources,Ministry of Agriculture,Shanghai Ocean University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hyriopsis cumingii pearl sac outer mantle immune factors |
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