白菜型油菜BrBBX家族的鉴定与BrBBX46和BrBBX53基因的胁迫响应分析 |
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作者姓名: | 皮博艺 聂治 杜文平 余桂容 甘雨 宋军 |
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作者单位: | 四川省农业科学院生物技术核技术研究所,四川 成都 610066 |
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基金项目: | 四川省财政自主创新专项(2022ZZCX028)。 |
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摘 要: | BBX是一类重要的锌指蛋白转录因子家族,包含1~2个高度保守位于蛋白质序列N端的BBX结构域,在调控植物的生长发育和响应环境胁迫中发挥着重要作用。利用生物信息学分析手段,在白菜型油菜中鉴定出59个BrBBX家族成员,对它们的染色体定位、基因结构、蛋白保守结构域,以及BrBBX46和BrBBX53基因的启动子进行了分析,并用qRT-PCR技术鉴定了BrBBX46和BrBBX53基因在模拟干旱和盐胁迫下的表达水平。结果显示,59个BrBBXs不均匀地分布于白菜型油菜基因组的10条染色体。通过对系统进化、基因结构、蛋白保守 结构域的分析,59个BrBBXs被分为5个亚族,每个亚族的基因结构、蛋白结构域和保守基序均相对保守,同一亚族的成员具有相似的基因结构和保守结构域。对启动子的分析结果显示,BrBBX46和BrBBX53基因的启动子中均含有大量的胁迫相关响应元件,尤其是干旱胁迫响应元件,二者均有14个;在40% PEG和120 mmol/L NaCl处理下,二者的表达水平均显著上升,说明BrBBX46和BrBBX53基因能够响应干旱和盐胁迫的诱导,可能在干旱和盐胁迫下发挥着重要功能。以上结果为进一步了解和利用BrBBX家族成员改良白菜型油菜耐旱耐盐新品种提供了良好的基因资源。
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关 键 词: | 白菜型油菜 BBX家族 BrBBX46 BrBBX53 生物信息学 胁迫响应 |
Identification of the BBX family in B. rapa and Stress Response Analysis of BrBBX46 and BrBBX53 Genes |
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Authors: | PI Boyi NIE Zhi DU Wenping YU Guirong GAN Yu SONG Jun |
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Institution: | Institute of Biotechnology & Nuclear Techniques, Sichuan Academy Agricultural Sciences, Chengdu Sichuan 610066, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | B rapa BBX family Identification BrBBX46 BrBBX53 Bioinformation Stress response |
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