布顿大麦TB1基因的克隆及内生真菌对其表达量的影响 |
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引用本文: | 韩丹,龙凤,陈胜,户萌菲,王栋,陈水红.布顿大麦TB1基因的克隆及内生真菌对其表达量的影响[J].草业学报,2023(8):176-185. |
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作者姓名: | 韩丹 龙凤 陈胜 户萌菲 王栋 陈水红 |
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作者单位: | 1. 塔里木大学生命科学与技术学院,塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室;2. 中国科学院深圳先进技术研究院;3. 塔里木大学动物科学与技术学院 |
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摘 要: | 分蘖生长在茎基部不伸长的节间,有不定根,能独立于主茎存活,禾本科作物布顿大麦主要通过分蘖来提高产量;内生真菌和基因均能调控布顿大麦分蘖,为了探究内生真菌对宿主植物分蘖相关基因TB1的影响,本研究利用RT-PCR法对布顿大麦TB1基因进行克隆并测序,采用生物信息学方法对该基因的序列结果进行分析,用SYBR Green荧光染料法对新疆温宿县和青海柴达木盆地带内生真菌(E+)和不带内生真菌(E-)的布顿大麦TB1基因进行q-PCR相对表达量分析。结果显示,克隆的TB1基因蛋白质编码区(CDS)全长为804 bp,编码267个氨基酸残基;TB1基因无启动子和PolyA位点;经亚细胞定位,TB1蛋白预计在液泡,TB1蛋白无跨膜结构域、无信号肽、不属于跨膜蛋白、存在于TCP家族;推测TB1蛋白为不稳定蛋白质。布顿大麦TB1基因与大麦亚种的TB1同源性最高,为96.72%,且与大麦亚种的TB1处于同一支系。温宿县和柴达木盆地布顿大麦根、茎、叶中TB1基因表达量趋势一致,内生真菌显著降低了植株分蘖发生部位茎基部的TB1基因表达量,表明内生真菌侵染影响了宿主TB1基因表达进而调控宿主植物分蘖。研究结果为...
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关 键 词: | 内生真菌 布顿大麦 TB1基因 荧光定量PCR |
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