采后黄瓜响应低温胁迫的转录组学分析

采后黄瓜对低温敏感，在低温贮藏期间很容易发生冷害，会造成较大的采后损失。本研究采用转录组测序结合生物信息学分析的方法，分析了采后黄瓜在短时冷害温度处理后的转录组变化。结果显示，采后黄瓜在5℃贮藏期间，冷害指数和相对电导率逐渐增加，叶绿素荧光逐渐降低，表明采后黄瓜在5℃贮藏期间产生了明显的冷害。与处理前相比（0 h），处理12 h导致1500个基因差异表达，其中706个基因表达上调，794个基因表达下调。与0 h相比，处理72 h导致7799个基因差异表达，其中3995个基因表达上调，3804个基因表达下调。KEGG富集结果显示，低温处理导致的差异表达基因显著富集在植物激素信号转导、苯丙氨酸代谢、植物与病原菌互作和苯丙烷素合成途径中。GO富集分析的结果显示，在生物过程分类下，差异表达基因主要参与以DNA为模板的转录调控、蛋白磷酸化和跨膜转运等过程；在细胞组份分类下，差异表达基因主要富集在细胞膜组份和细胞核；在分子功能分类下，差异表达基因主要与ATP结合、蛋白苏氨酸/丝氨酸激酶活性、DNA结合和转录因子活性等功能有关。在低温处理12 h时，与激素信号有关的基因显著表达。但在低温处理72 h...