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低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价
引用本文:林珲,裘波音,朱海生,等. 低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价 [J]. 福建农业科技,2024,55(8):01−15. DOI: 10.13651/j.cnki.fjnykj.2024.08.001
作者姓名:林珲  裘波音  朱海生  温庆放
作者单位:福建省农业科学院作物研究所/福建省蔬菜遗传育种重点实验室/福建省蔬菜工程技术研究中心,福建 福州 350013
基金项目:福建省科技计划省属公益类项目(2021R1031003);国家大宗蔬菜产业技术体系福州综合试验站项目(CARS-23-G-53);福建省种业创新与产业化工程项目(zycxny2021009);福建省农业科学院科技创新平台专项(CXPT202001);福建省农业科学院蔬菜遗传育种科技创新团队(CXTD2021038)。
摘    要:
为了探索茄子Solanum melongena L.的基因表达模式,利用qRT-PCR方法分析了茄子ACT、EF1α、TUA、TUB、GAPDH、eIF、UBQ、UBI3、PP2A、CYP、RPL28、L25、SAND、TBP、DNAJ、APRT、EXP、CAC、HSP20CysPro 20个候选内参基因mRNA的表达差异情况,并运用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3种计算方法评价茄子20个候选内参基因在低温、弱光、低温弱光叶片样品中的表达稳定性。结果表明:茄子20个候选内参基因荧光定量引物扩增效率(E)数值在96.8%~117.6%,相关系数(R2)介于0.968 8~0.999 9,扩增效率良好,扩增反应具有高度的专一性,引物能特异性扩增,特异性好,均为单峰,样品间扩增曲线重复性强,可用于qRT-PCR扩增。茄子20个候选内参基因CT值表达丰度分析,发现茄子20个候选内参基因平均CT值在19.76~31.20。
3种计算方法的综合评价分析结果显示,TBP基因在所有样本中为最稳定的内参基因。研究可为茄子低温、弱光和低温弱光胁迫下基因特异性表达研究提供了合适的内参基因。


关 键 词:茄子  内参基因  实时荧光定量PCR  标准化  基因表达
收稿时间:2024-07-14
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