| 基于小RNA深度测序技术鉴定侵染我国部分省市草莓种苗的病毒种类 |
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| 引用本文： | 王 佳#,白莹雪#,祝 宁,齐长红,任俊达,韩成贵,尚巧霞.基于小RNA深度测序技术鉴定侵染我国部分省市草莓种苗的病毒种类[J].植物保护,2022,48(3):225-232. |
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| 作者姓名： | 王 佳# 白莹雪# 祝 宁 齐长红 任俊达 韩成贵 尚巧霞 |
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| 作者单位： | 1. 北京农学院,农业农村部华北都市农业重点实验室, 北京 102206; 2. 北京市昌平区农业技术推广站, 北京 102200; 3. 中国农业大学植物病理学系, 农业生物技术国家重点实验室, 北京 100193 |
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| 基金项目： | 北京市粮经作物产业创新团队项目(BAIC09-2021) |
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| 摘 要： | 随着草莓保护地栽培面积的增加和无性繁殖种苗的繁殖与调运，草莓病毒病的发生与流行日益严重。为明确侵染我国部分省市草莓种苗的病毒种类，应用小RNA深度测序技术进行检测，并利用RT-PCR技术对结果进行验证及序列分析。结果表明，从来自我国7省市的41株具有典型病毒病症状的草莓种苗样品中检测到草莓斑驳病毒strawberry mottle virus (SMoV)、草莓镶脉病毒strawberry vein banding virus(SVBV)和草莓轻型黄边病毒strawberry mild yellow edge virus (SMYEV)3种。SMoV、SVBV和SMYEV的检出率分别为34.1%、24.4%和2.4%。选取不同产地草莓种苗上检出的不同病毒进行部分序列测定和分析，获得了3个SMoV分离物(四川分离物schhy13、辽宁分离物lnhy23和河北分离物hbhy28)的部分RNA1 3′端非编码区606 bp核苷酸序列，其一致性为98.12%～99.34%。测定并获得了5个SVBV分离物(辽宁分离物lnhy15、lnhy17、lnhy24、河北分离物hbhy28和陕西分离物sh...
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| 关 键 词： | 草莓病毒病 小RNA深度测序技术 RT-PCR 病毒检测 |
| 收稿时间： | 2021/2/8 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/3/11 0:00:00 |
Identification of viruses infecting strawberry seedlings in some provinces of China by small RNA deep sequencing technology |
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| WANG Jia#,BAI Yingxue#,ZHU Ning,QI Changhong,REN Jund,HAN Chenggui,SHANG Qiaoxia.Identification of viruses infecting strawberry seedlings in some provinces of China by small RNA deep sequencing technology[J].Plant Protection,2022,48(3):225-232. |
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| Authors: | WANG Jia# BAI Yingxue# ZHU Ning QI Changhong REN Jund HAN Chenggui SHANG Qiaoxia |
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| Institution: | 1. Key Laboratory for Northern Urban Agriculture of Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China; 2. Agricultural Technology Extension Station of Changping District in Beijing, Beijing 102200, China; 3. Department of Plant Pathology, State Key Laboratory for Agro-Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | strawberry viral disease small RNA deep sequencing technology RT-PCR virus detection |
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