| 小麦TaSnRK2.9蛋白激酶基因克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 连魏卫,唐益苗,高世庆,张朝,赵昌平.小麦TaSnRK2.9蛋白激酶基因克隆与生物信息学分析[J].中国农学通报,2011,27(33):6-12. |
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| 作者姓名： | 连魏卫 唐益苗 高世庆 张朝 赵昌平 |
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| 作者单位： | 1. 首都师范大学生命科学学院,北京100048;北京杂交小麦工程技术研究中心,北京100097
2. 北京杂交小麦工程技术研究中心,北京,100097 |
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| 基金项目： | 国家转基因生物新品种培育重大专项(2008ZX08002-002,2008ZX08002-003,2008ZX08002-004); 北京市科技新星项目(2007B056,2008B035); 北京农林科学院院青年基金项目; 北京市自然基金项目(5102016) |
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| 摘 要： | 为了揭示小麦TaSnRK2.9基因的结构特点和功能特性，为该基因的研究和应用提供基础，根据已报道的水稻蛋白激酶SAPK9基因（GenBank登录号AB125310.1）序列信息，利用RT-PCR技术克隆了小麦TaSnRK2.9基因，并对其进行生物信息学分析。结果表明：小麦TaSnRK2.9阅读框为1092 bp，编码363个氨基酸，与水稻SAPK9亲缘关系最近，属于第三亚家族；亚细胞定位预测TaSnRK2.9定位在细胞质中；基因表达谱分析发现TaSnRK2.9在根、茎、叶、花等器官和组织中都有表达，并且在叶中的表达量最高。TaSnRK2.9的克隆为研究其在小麦中的功能提供基本信息和指导。
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| 关 键 词： | 铬污染 铬污染 土壤 植物 富集 |
| 收稿时间： | 2011/4/27 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2011/8/17 0:00:00 |
Identification and Bioinformatics Analysis of TaSnRK2.9 in Wheat |
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| Lian Weiwei
,
Tang Yimiao
,
Gao Shiqing
,
Zhang Zhao
,
Zhao Changping.Identification and Bioinformatics Analysis of TaSnRK2.9 in Wheat[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2011,27(33):6-12. |
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| Authors: | Lian Weiwei Tang Yimiao Gao Shiqing Zhang Zhao Zhao Changping |
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| Institution: | Lian Weiwei1,2,Tang Yimiao2,Gao Shiqing2,Zhang Zhao2,Zhao Changping2 (1College of Life Science,Capital Normal University,Beijing 100048,2Beijing Engineering and Technique Research Center of Hybrid Wheat,Beijing 100097) |
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| Abstract: | In order to reveal the structure and function characteristics of TaSnRK2.9 in wheat, and provide the basis for the research and application of this gene, the cDNA of TaSnRK2.9 was cloned in wheat by RT-PCR based on the nucleotide sequence of SAPK9 gene in rice, and the bioinformatics analysis was also finished. The results showed that the length of ORF was 1092 bp, encoding 363 amino acids. Sequence analysis and the phylogenetic trees showed that this gene was closely related to SAPK9 (AB125310) of rice, be... |
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| Keywords: | wheat TaSnRK2 9 cDNA RT-PCR phylogenetic analysis expression pattern |
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