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禾谷炭疽菌腺苷酸环化酶的生物信息学分析
引用本文:韩长志. 禾谷炭疽菌腺苷酸环化酶的生物信息学分析[J]. 贵州农业科学, 2014, 0(10)
作者姓名:韩长志
作者单位:西南林业大学 林学院,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南 昆明 650224
基金项目:云南省教育厅科学基金项目“核桃炭疽病菌 Gα-GTP 的效应分子在生长发育与致病过程中的功能研究”(2014Y330);云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目“滇西地区核桃炭疽病菌的防治及多菌灵对其作用机制研究”,“滇西地区核桃炭疽病菌的鉴定及对多菌灵抗药性研究”(ZK11SB01)”
摘    要:为了给禾谷炭疽菌新靶标药物的研究开发提供参考,以酿酒酵母的典型腺苷酸环化酶(AC)序列为基础,利用炭疽菌属蛋白数据库在线对其进行 Blastp 比对及关键词搜索,通过 SMART 对该菌典型AC 蛋白的保守结构域、理化性质、细胞信号肽、跨膜区结构以及二级结构等生物信息学进行分析,同时比较禾谷炭疽菌中典型 AC 氨基酸序列与其他物种同源序列的遗传关系。结果表明:禾谷炭疽菌中存在一个与酿酒酵母 Srv2同源的序列,命名为 CgCap1腺苷酸环化酶蛋白,该酶蛋白包含有530个氨基酸,基因序列长1906 bp 具有保守 CARP 结构域,等电点蛋白在5~6范围,属亲水性、不稳定蛋白,不含信号肽序列,定位于质膜上,二级结构中的β折叠所占比例较低,与同属于炭疽菌属真菌胶孢炭疽菌、西瓜炭疽菌的亲缘关系较近。

关 键 词:禾谷炭疽菌  腺苷酸环化酶  理化性质  亚细胞定位  二级结构

Bioinformatics Analysis of Adenylate Cyclase (AC)in Col letotrichum graminicola
HAN Changzhi. Bioinformatics Analysis of Adenylate Cyclase (AC)in Col letotrichum graminicola[J]. Guizhou Agricultural Sciences, 2014, 0(10)
Authors:HAN Changzhi
Abstract:
Keywords:Colletotrichum graminicola  adenylate Cyclase (AC)  physicochemical property  sub-cellular localization  secondary structure
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