黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析 |
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引用本文: | 覃悦,祝友朋,韩长志.黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析[J].华中农业大学学报,2020,39(6):30-36. |
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作者姓名: | 覃悦 祝友朋 韩长志 |
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作者单位: | 西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明 650224;西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明 650224;西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明 650224 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31960314);云南省应用基础研究计划项目(2018FG001-028);云南省研发经费投入补助项目(2016YB462&2017YB236) |
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摘 要: | 基于全基因组序列已经公布的黄单胞菌Xanthomonas campestris B100、Xanthomonas campestris pv. campestris 8004、Xanthomonas campestris CN14中分泌蛋白序列为基础数据,采用Protscale、SMART、TargetP 2.0 Server等生物信息学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、保守结构域以及转运肽等分析,结果显示:黄单胞菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关关系, 44.73%的蛋白为不稳定蛋白, 83.21%的蛋白亲水性小于0,属于亲水性蛋白。同时,在每种黄单胞菌的分泌蛋白中,具有明显保守结构域的蛋白数量平均为12个,并且所有分泌蛋白均具有信号肽,转运肽预测可能性分布也较为平均。
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关 键 词: | 黄单胞菌 分泌蛋白 理化性质 生物信息学分析 植物病原菌 亚细胞定位 转运肽 |
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