| 甘蓝型油菜BnaWRKY30-like基因cDNA序列克隆 及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 尹明智,胡燕. 甘蓝型油菜BnaWRKY30-like基因cDNA序列克隆 及生物信息学分析[J]. 安徽农业大学学报, 2020, 47(5): 832 |
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| 作者姓名： | 尹明智 胡燕 |
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| 作者单位： | 遵义师范学院生物与农业科技学院，遵义 563006 |
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| 基金项目： | 贵州省科学技术厅、遵义市科学技术局、遵义师范学院联合科技基金资助（黔科合LH字[2016]7016号）, 贵州省高层次创新型人才培养计划项目（遵市科合人才[2017] 11号）, 遵义师范学院2017年学术新苗培养及创新探索项目培育项目（黔科合平台人才[2017年]5727-15号）共同资助。 |
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| 摘 要： | ![]()
WRKY 转录因子是植物所特有的一个超级基因家族，能调控植物生长发育过程及逆境反应。根据转录组测序获得的 EST 序列设计引物, 利用 RT-PCR 及 RACE 技术克隆了甘蓝型油菜WRKY30 基因 cDNA 全长序列, 并运用生物信息学手段对序列进行了分析及预测。结果表明：BnaWRKY30-like 基因全长cDNA序列中包含102 bp 的5′-UTR序列，188 bp 的3′-UTR序列以及942 bp的完整ORF，编码313个氨基酸。该转录因子蛋白相对分子量为35 319.85D，等电点为 6.22，基本氨基酸中含量最高的丝氨酸（Ser），313个氨基酸中含有41个酸性氨基酸，34个碱性氨基酸，在121～182区域含有一个典型的WRKY结构域。亚细胞定位预测发现该转录因子定位于细胞核的可能性最高。蛋白质的二级结构预测表明共有α-螺旋占26.20%，延伸链占10.54%，β-转角占4.47%，无规则卷曲占58.79%。BnaWRKY30-like基因编码的蛋白具有典型的WRKY转录因子特征，与拟南芥WRKY30基因亲缘关系近，可能在油菜早期生长发育过程及盐胁迫中的发挥调控作用。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜；WRKY转录因子；基因克隆；RACE技术；生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2020-01-29 |
Cloning and bioinformatics analysis of cDNA sequence of BnaWRKY30-like gene in Brassica napus |
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| YIN Mingzhi,HU Yan. Cloning and bioinformatics analysis of cDNA sequence of BnaWRKY30-like gene in Brassica napus[J]. Journal of Anhui Agricultural University, 2020, 47(5): 832 |
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| Authors: | YIN Mingzhi HU Yan |
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| Affiliation: | College of Biology and Agricultural Science & Technology,Zunyi Normal University, Zunyi 563006 |
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| Abstract: | ![]()
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