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利用OneMap软件构建鲤遗传连锁图谱
作者姓名:高国强  常玉梅  匡友谊  梁利群
作者单位:1. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306
2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070
基金项目:国家“九七三”计划资助项目(2004CB117400); 农业部水产生物技术重点开放实验室(2009NYBZS-05); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2009HSYZX-SJ-05)
摘    要:首次使用R环境中的OneMap软件包,以荷包红鲤抗寒品系(♂)和云南大头鲤(♀)为祖父母本所培育的110个F2个体为作图群体,以荧光扩增片段长度多态性(fluorescent amplification fragment length polymorphism,fAFLP)为主要分子标记,采用远交全同胞家系模型构建鲤的遗传连锁图谱。结果显示,110个F2个体中共产生1513个清晰的fAFLP标记,其中多态性标记911个;另开发多态性的EST标记12个,最后总计923个标记用于构建遗传连锁图谱;采用OneMap软件包构建的遗传图谱含有238个fAFLP标记和8个EST标记分布在50个连锁群上,总图距为2876.64cM,标记间平均间距为14.68cM,图谱覆盖率为66.56%。

关 键 词:  遗传连锁图谱  荧光扩增片段长度多态性  OneMap  
收稿时间:2009-12-15
修稿时间:2010-03-06
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