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旱稻孢囊线虫在广西的发生及其rDNA-ITS异质性分析
引用本文:卓侃,宋汉达,王宏洪,陶冶,张洪玲,陆秀红,黄金玲,刘志明,廖金铃.旱稻孢囊线虫在广西的发生及其rDNA-ITS异质性分析[J].中国水稻科学,2014,28(1):78-84.
作者姓名:卓侃  宋汉达  王宏洪  陶冶  张洪玲  陆秀红  黄金玲  刘志明  廖金铃
作者单位:华南农业大学 资源环境学院 植物线虫研究室, 广州 510642;广西农业科学院 植物保护研究所, 南宁 530007;
基金项目:公益性行业(农业)科研专项经费资助项目(200903040)。
摘    要:2011年,从广西龙胜梯田的水稻根系和稻田土壤中分离到一种孢囊线虫。该线虫形态特征与已报道的旱稻孢囊线虫(Heterodera elachista)相符,其rDNA-ITS序列与GenBank中旱稻孢囊线虫的rDNA-ITS序列相似性为97.7%~99.3%。rDNA-ITS分子发育树表明该线虫与旱稻孢囊线虫以100%的置信度及较小的遗传距离形成一个单系,据此将该线虫鉴定为旱稻孢囊线虫。进一步对本研究获得的10条旱稻孢囊线虫rDNA-ITS区序列及Tanha Maafi等报道的1条旱稻孢囊线虫rDNA-ITS序列(AF498391)的酶切位点进行分析,结果发现AluⅠ、AvaⅠ、MvaⅠ和RsaⅠ4个内切酶的酶切位点在11条序列中完全一致,而Bsh1236Ⅰ、BsuRⅠ和CfoⅠ3种酶的酶切位点存在变异,其中Bsh1236Ⅰ和BsuRⅠ有2种变异型,CfoⅠ则有3种变异型,表明旱稻孢囊线虫的rDNA-ITS序列存在DNA异质性。

关 键 词:旱稻孢囊线虫  水稻  鉴定  rDNA-ITS  异质性
收稿时间:2013-07-30;

Occurence of Heterodera elachista in Guangxi Region and Its Intra species Heterogeneity in rDNA ITS Region
ZHUO Kan,SONG Han da,WANG Hong hong,TAO Ye,ZHANG Hong ling,LU Xiu hong,HUANG Jin ling,LIU Zhi ming,LIAO Jin ling.Occurence of Heterodera elachista in Guangxi Region and Its Intra species Heterogeneity in rDNA ITS Region[J].Chinese Journal of Rice Science,2014,28(1):78-84.
Authors:ZHUO Kan  SONG Han da  WANG Hong hong  TAO Ye  ZHANG Hong ling  LU Xiu hong  HUANG Jin ling  LIU Zhi ming  LIAO Jin ling
Institution:Laboratory of Plant Nematology, College of Natural Resource and Environment, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China; Plant Protection Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, China;
Abstract:
Keywords:Heterodera elachista  rice  identification  rDNA ITS  heterogeneity
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