| 苦荞蔗糖转运体家族FtSUCs的鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 梁成刚,汪燕,关志秀,韦春玉,邓娇,黄娟,孟子烨,石桃雄.苦荞蔗糖转运体家族FtSUCs的鉴定与生物信息学分析[J].浙江农业学报,2022,34(8):1591. |
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| 作者姓名： | 梁成刚 汪燕 关志秀 韦春玉 邓娇 黄娟 孟子烨 石桃雄 |
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| 作者单位： | 贵州师范大学 生命科学学院 荞麦产业技术研究中心, 贵州 贵阳 550001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(32060511);国家自然科学基金(31660366);贵州省科技支撑计划(黔科合ZC20192298);贵州师范大学博士启动基金项目;贵州省荞麦种质资源保护与创新重点实验室建设项目(黔教合KY2017002) |
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| 摘 要： | 植物蔗糖转运体家族蛋白( sucrose transporter, SUC)是介导蔗糖跨膜运输的重要载体。本文基于苦荞幼苗发育过程中转录组测序获得的数据库,筛选鉴定到10个FtSUCs基因,序列长度在1 436~7 109 bp,编码氨基酸148~605个,其中8个FtSUCs可能定位于内质网,其序列一致性为34.30%,保守位点达到20个。苦荞FtSUCs与拟南芥AtSUCs基因被聚为3类,FtSUCs中4个归入类型Ⅰ,2个归入类型Ⅱ,4个归入类型Ⅲ。苦荞FtSUCs蛋白主要由α-螺旋、不规则卷曲、延长链与β-折叠组成,其中9个FtSUCs包含跨膜结构域。幼苗发育过程中,FtSUCs基因间表达模式存在差异,其中,FtPinG0002608200.01、FtPinG0001943900.01、FtPinG0001944100.01在子叶期高表达,FtPinG0000342600.01表达量逐渐提高,FtPinG0001943500.01和FtPinG0009584000.01在各时期稳定表达,推测它们可能在不同发育阶段发挥特定功能。苦荞中多个FtSUCs基因存在显著正相关或负相关关系,暗示FtSUCs基因间可能存在协同效应或功能互补,进而共同调控蔗糖的跨膜运输。
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| 关 键 词： | 苦荞 蔗糖转运体基因 生物信息学 基因表达模式 |
| 收稿时间： | 2021-03-17 |
Identification and bioinformatics analysis of sucrose transporter family FtSUCs in Tartary buckwheat |
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| LIANG Chenggang,WANG Yan,GUAN Zhixiu,WEI Chunyu,DENG Jiao,HUANG Juan,MENG Ziye,SHI Taoxiong.Identification and bioinformatics analysis of sucrose transporter family FtSUCs in Tartary buckwheat[J].Acta Agriculturae Zhejiangensis,2022,34(8):1591. |
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| Authors: | LIANG Chenggang WANG Yan GUAN Zhixiu WEI Chunyu DENG Jiao HUANG Juan MENG Ziye SHI Taoxiong |
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| Institution: | Buckwheat Technology Research Center, College of Life Science, Guizhou Normal University,Guiyang 550001, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Tartary buckwheat sucrose transporter gene bioinformatics gene expressing pattern |
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