首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析
引用本文:刘晓晗,王 峰,李丹蕾,董爱荣,陈俏丽,王博文,零雅茗,江珊,段颜祯,张玉洲.基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析[J].中国农学通报,2015,31(7):175-179.
作者姓名:刘晓晗  王 峰  李丹蕾  董爱荣  陈俏丽  王博文  零雅茗  江珊  段颜祯  张玉洲
作者单位:零雅茗,零雅茗,零雅茗,零雅茗,零雅茗,零雅茗,东北林业大学,东北林业大学,东北林业大学,东北林业大学
基金项目:基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金项目“基于RNA-Seq策略研究杨树抗杨褐盘二孢菌侵染分子机理”(DL13BA01);高等学校博士学科点专项科研基金资助课题(博士点新教师基金资助项目)“水稻干尖线虫诱导水稻防卫反应基因及其相应microRNA克隆与分析”(20100062120002);林业公益性项目“大兴安岭药用真菌、黄芪栽培”(201004079)。
摘    要:为了寻找线虫生殖相关基因,为开发线虫生殖抑制药剂提供理论基础,通过分析水稻干尖线虫转录组文库高通量测序数据,对Unigene进行KEGG路径分析,筛选出一个孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径(progesterone-mediated oocyte maturation),并筛选出该路径的主要调控基因——锌指蛋白基因。通过同源序列比对发现水稻干尖线虫锌指蛋白氨基酸序列中含有核酸结合保守结构域NLS,进一步通过三维结构分析及分子对接验证该蛋白可与DNA分子结合。结果表明,水稻干尖线虫锌指蛋白可与其调控基因的启动子结合从而完成对孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径的调控。通过本研究得出最终结论,水稻干尖线虫锌指蛋白具有生物防治价值,值得深入研究。

关 键 词:水稻干尖线虫  锌指蛋白  卵母细胞形成
收稿时间:2014/11/11 0:00:00
修稿时间:2015/2/22 0:00:00

Genetic Cloning of A Zinc Finger Protein from Aphelenchoides besseyi (Aphelenchida: Aphelenchoididae)
Liu Xiaohan,Wang Feng,Li Danlei,Dong Airong,Chen Qiaoli,Wang Bowen,and.Genetic Cloning of A Zinc Finger Protein from Aphelenchoides besseyi (Aphelenchida: Aphelenchoididae)[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2015,31(7):175-179.
Authors:Liu Xiaohan  Wang Feng  Li Danlei  Dong Airong  Chen Qiaoli  Wang Bowen  and
Institution:Ling Yaming, Jiang Shan, Duan Yanzhen, Zhang Yuzhou(Northeast Forestry University,Ling Yaming, Jiang Shan, Duan Yanzhen, Zhang Yuzhou(Northeast Forestry University,Ling Yaming, Jiang Shan, Duan Yanzhen, Zhang Yuzhou(Northeast Forestry University,Ling Yaming, Jiang Shan, Duan Yanzhen, Zhang Yuzhou(Northeast Forestry University,Ling Yaming, Jiang Shan, Duan Yanzhen, Zhang Yuzhou(Northeast Forestry University,Ling Yaming, Jiang Shan, Duan Yanzhen, Zhang Yuzhou(Northeast Forestry University,,,,
Abstract:
Keywords:Aphelenchoides besseyi  zinc finger protein  microRNA  oocyte maturation
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
点击此处可从《中国农学通报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《中国农学通报》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号