| 玉米SNAC转录因子的基因结构特征与逆境调控预测 |
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| 引用本文： | 罗平,庞博,崔进鑫,于爽,王晓楠,程名,陈勇,高文伟,郝转芳. 玉米SNAC转录因子的基因结构特征与逆境调控预测[J]. 中国农业科技导报, 2021, 23(10): 35-44. DOI: 10.13304/j.nykjdb.2020.0657 |
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| 作者姓名： | 罗平 庞博 崔进鑫 于爽 王晓楠 程名 陈勇 高文伟 郝转芳 |
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| 作者单位： | 1.新疆农业大学农学院， 乌鲁木齐 830000； 2.中国农业科学院作物科学研究所， 北京 100081 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金国际合作项目(31661143010);国家重点研发计划项目（2016YFD0101803） |
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| 摘 要： | NAC蛋白是植物特有的转录因子，在植物发育和各种非生物逆境应答中发挥着重要作用。为更好地揭示玉米SNAC(stress-responsive NAM,ATAF1/2,CUC2)家族的耐逆境胁迫功能，对其基因的结构特征及可能的调控机理进行了预测。利用生物信息学方法，鉴定了玉米16个SNAC家族基因，并对该基因家族各编码蛋白的理化性质、基因结构、潜在的磷酸化位点、蛋白质二级结构、基因进化关系、基因组序列结构和启动子结合元件等信息进行分析。分析结果表明：玉米16个SNACs不具有跨膜结构，且均具有N-末端保守结构域和高度可变的C-末端结构域。系统发育分析表明，同一亚群中密切相关的成员具有相似的基因结构，推测在不同植物中会具有类似的耐逆功能。磷酸化位点分析表明，玉米SNAC家族存在着大量的磷酸化位点。二级结构预测表明，玉米SNAC的转录调控区具有高度的内在灵活性。启动子分析表明，玉米SNAC家族基因启动子区域均含有大量的逆境胁迫应答顺式作用元件。这些结果为玉米耐逆境研究提供了候选基因，对促进玉米SNAC家族功能分析的进展具有重要意义。
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| 关 键 词： | 玉米（Zea Mays L.） SNAC基因家族 基因结构特征 逆境胁迫 |
| 收稿时间： | 2020-07-27 |
Gene Structural Characteristics and Regulation Prediction of SNAC Transcription Factors Against Stresses in Maize |
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| LUO Ping,PANG Bo,CUI Jinxin,YU Shuang,WANG Xiaonan,CHENG Ming,CHEN Yong,GAO Wenwei,HAO Zhuangfang. Gene Structural Characteristics and Regulation Prediction of SNAC Transcription Factors Against Stresses in Maize[J]. Journal of Agricultural Science and Technology, 2021, 23(10): 35-44. DOI: 10.13304/j.nykjdb.2020.0657 |
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| Authors: | LUO Ping PANG Bo CUI Jinxin YU Shuang WANG Xiaonan CHENG Ming CHEN Yong GAO Wenwei HAO Zhuangfang |
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| Affiliation: | 1.College of Agriculture, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830000, China; 2.Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | maize (Zea Mays L.) SNAC gene family gene structural characteristics biotic and abiotic stresses |
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