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甘肃河西地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传变异研究
引用本文:梁春花,刘霞,罗玉柱,孙雪婧,高雪晋,杨阳,曾国敏,杜晓华.甘肃河西地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传变异研究[J].华北农学报,2015(2).
作者姓名:梁春花  刘霞  罗玉柱  孙雪婧  高雪晋  杨阳  曾国敏  杜晓华
作者单位:1. 甘肃农业大学 动物医学院,甘肃 兰州 730070; 甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃 兰州 730070
2. 甘肃农业大学 生命科学技术学院,甘肃 兰州 730070; 甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃 兰州 730070
3. 甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃 兰州,730070
4. 甘肃农业大学 生命科学技术学院,甘肃 兰州,730070
5. 甘肃农业大学 动物医学院,甘肃 兰州,730070
基金项目:甘肃省高等学校基本科研业务费资助项目(2013);甘肃省教育厅研究生导师项目
摘    要:为研究甘肃河西的临泽、甘州、凉州、金昌、高台5个地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传多态性及其变异特征,采用PCR-SSCP方法检测了283头西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子和部分内含子的多态性,并对群体内各等位基因进行了测序。结果显示:5个地区西门塔尔杂交类群共检测出5个等位基因(A、B、C、D、E),表现为6种基因型(AA、BB、AB、AC、AD、AE)。5个地区西门塔尔杂交类群均能检测到AA、BB、AB 3种基因型,且甘州、凉州、高台西门塔尔杂交类群还分别检测到AC、AD、AE 3种基因型。A等位基因频率在5个群体中最高,为优势等位基因。对不同SSCP带型的对应片段进行测序分析,共发现5个核苷酸突变位点(31 bp C→T、68 bp G→C和G→A、129 bp A→G、207 bp C→T),5处突变中仅第207 bp处单核苷酸突变落在外显子区域,其余均落在内含子区域,但均未导致氨基酸发生改变。χ2检验结果显示,5个地区西门塔尔杂交类群在第207 bp处单核苷酸突变位点上仅凉州、金昌西门塔尔杂交类群处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。群体遗传学分析结果表明,临泽、甘州、凉州、金昌、高台西门塔尔杂交类群的多态信息含量(PIC)分别为0.358 2,0.383 9,0.427 9,0.368 2,0.394 7,均属于中度多态(0.25PIC0.5)。

关 键 词:西门塔尔杂交类群  NGB基因  外显子  遗传变异

Genetic Variation Study of NGB Gene Exon 4 of Simmental Cattle Hybrid Taxon in Gansu Hexi Regions
LIANG Chun-hua,LIU Xia,LUO Yu-zhu,SUN Xue-jing,GAO Xue-jin,YANG Yang,ZENG Guo-min,DU Xiao-hua.Genetic Variation Study of NGB Gene Exon 4 of Simmental Cattle Hybrid Taxon in Gansu Hexi Regions[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2015(2).
Authors:LIANG Chun-hua  LIU Xia  LUO Yu-zhu  SUN Xue-jing  GAO Xue-jin  YANG Yang  ZENG Guo-min  DU Xiao-hua
Abstract:
Keywords:Simmental cattle hybrid taxon  NGB gene  Exon  Genetic variation
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