| 植物镉富集PCS基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 丁亚娜,陈永坤,刘海珍,赵启红,徐吉臣.植物镉富集PCS基因的生物信息学分析[J].核农学报,2015,29(5). |
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| 作者姓名： | 丁亚娜 陈永坤 刘海珍 赵启红 徐吉臣 |
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| 作者单位： | 北京林业大学/林木育种国家工程实验室,北京,100083 |
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| 摘 要： | 植物络合素是植物细胞中的小分子多肽,可以螯合重金属离子并储存于液泡中,起到降低毒性和富集重金属的作用.植物络合素合酶基因(PCS)是植物络合素合成过程的关键基因,本研究对15种植物镉(Cd2+)富集相关的PCS基因序列进行了生物信息学分析.结果表明,PCS具有保守的外显子组成;位于PCS肽链N端的氨基酸序列一致率达到82.54％,位于C端的氨基酸序列一致率为63.37％;PCS含量最多的氨基酸为亮氨酸(11.17％),色氨酸含量最少(1.63％);PCS具有保守的催化活性中心Cys70、His176、Asp194;不同PCS基因的密码子偏好使用性差异明显,高频密码子平均数量超过9个.研究结果显示,不同PCS基因既有保守的结构组成,也显现出种属的差异,可以用于物种的分类和亲缘关系分析.研究结果为PCS基因的功能及作用机制研究提供了重要的科学依据.
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| 关 键 词： | Cd2+ 植物络合素合酶 抗性 富集 生物信息学 |
Bioinformatics Analysis of the PCS Genes Related With Cadmium Enrichment in Plants |
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| DING Yana,CHEN Yongkun,LIU Haizhen,ZHAO Qihong,XU Jichen.Bioinformatics Analysis of the PCS Genes Related With Cadmium Enrichment in Plants[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2015,29(5). |
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| Authors: | DING Yana CHEN Yongkun LIU Haizhen ZHAO Qihong XU Jichen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cadmium PCS resistance enrichment bioinformatics |
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