| 柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序 |
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| 引用本文： | 夏润玺,李玉萍,王欢,李喜升,刘彦群,秦利,姜德富,鲁成.柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序[J].蚕业科学,2009,35(3). |
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| 作者姓名： | 夏润玺 李玉萍 王欢 李喜升 刘彦群 秦利 姜德富 鲁成 |
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| 作者单位： | 沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳,110161;辽宁省蚕业科学研究所,辽宁凤城,118100;西南大学,农业部蚕桑学重点开放实验室,重庆,400716 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，现代农业产业技术体系建设专项;公益性行业(农业)科研专项，辽宁省教育厅高校科研项目，沈阳农业大学青年教师科研基金项目 |
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| 摘 要： | 采用RNA转录5′末端转换(SMART)技术构建了柞蚕(Antheraea pernyi)蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×105个独立克隆,插入片段长800~2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签(EST)测序,有效序列为250条,根据EST测序结果计算文库重组率达95%。经序列拼接得到175个unigenes,通过序列比对发现其中97个unigenes与GenBank中的已知基因高度同源,且有88条全长序列,基因的完整性比率达90%。在随机EST测序中获得了具有5′端和3′端非编码区的延伸因子-1α基因(Gen-Bank登录号:FJ788508),该基因cDNA全长1743 bp,有一个1392 bp的开放阅读框,编码含463个氨基酸残基的蛋白,蛋白的理论分子质量为50.4 kD,等电点8.96。EST测序分析表明,柞蚕蛹cDNA文库符合构建基因文库的质量要求,该文库的构建将有助于柞蚕功能基因的克隆和研究。
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| 关 键 词： | 柞蚕 cDNA文库 RNA转录5′末端转换 表达序列标签 延伸因子-1α(EF-1α) |
Construction of a Full-length cDNA Library From Antheraea pernyi Pupae and Random Sequencing of Expressed Sequence Tags |
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| XIA Run-Xi,LI Yu-Ping,WANG Huan,LI Xi-Sheng,LIU Yan-Qun,QIN Li,JIANG De-Fu,LU Cheng.Construction of a Full-length cDNA Library From Antheraea pernyi Pupae and Random Sequencing of Expressed Sequence Tags[J].Acta Sericologica Sinica,2009,35(3). |
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| Authors: | XIA Run-Xi LI Yu-Ping WANG Huan LI Xi-Sheng LIU Yan-Qun QIN Li JIANG De-Fu LU Cheng |
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| Institution: | XIA Run-Xi1 LI Yu-Ping1 WANG Huan1 LI Xi-Sheng2 LIU Yan-Qun1* QIN Li1 JIANG De-Fu2 LU Cheng3 (1College of Bioscience , Biotechnology,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110161,China,2Liaoning Sericultural Institute,Fengcheng Liaoning 118100,3The Key Sericultural Laboratory of Agricultural Ministry,Southwest University,Chongqing 400716,China) |
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