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| 禽呼肠孤病毒C-98、T-98分离株S2基因的克隆及序列分析 | |
| 引用本文： | 何建文,党娟,关平原,李平安,高魁.禽呼肠孤病毒C-98、T-98分离株S2基因的克隆及序列分析[J].畜牧与饲料科学,2013,34(1):18-23. |
| 作者姓名： | 何建文 党娟 关平原 李平安 高魁 |
| 作者单位： | 1. 内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特,010018 2. 内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特010018;农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室,内蒙古 呼和浩特010018 3. 内蒙古鄂尔多斯市东胜区兽医局,内蒙古东胜区,017000 |
| 基金项目： | 内蒙古自然科学基金资助项目 |
| 摘 要： | 参考GenBank中禽呼肠孤病毒176株(ARV 176)S2基因设计引物,对禽呼肠孤病毒内蒙古地区分离株C-98和禽呼肠孤病毒天津地区分离株T-98进行总RNA的提取,以其为模板,应用RT-PCR方法扩增病毒S2基因的cDNA片段,将纯化的cDNA片段克隆到pEASY-T1载体后进行序列测定。结果表明,获得的ARV C-98和ARV T-98的S2基因全长为1324bp,包括15bp的5′非编码区和58bp的3′非编码区,阅读框位于5′端第16位核苷酸和第1266位核苷酸之间。ARV C-98和ARV T-98分离株S2基因的核苷酸同源性很高,达到了99.8%,将C-98、T-98株的S2基因核苷酸序列和参考毒株的S2基因序列进行同源性分析,结果表明,ARV C-98和ARV T-98分离株的S2基因与参考毒株ARV 176、ARV 918、ARV 919、ARV 1733、ARV GX2010、ARV S1133和DRV YJLS2基因的核苷酸同源性最高,在99.2%～99.8%之间;与参考毒株ARV 138和ARV AVS-BS2基因的核苷酸同源性在92.1%～94.1%之间;与参考毒株ARV601SI、ARV 916和ARV 1017-1S2基因的核苷酸同源性在87.3%～87.8%之间;与参考毒株DRV 091、DRV S12和DRV S14 S2基因的核苷酸同源性在77.3%～78.2%之间;与参考毒株MRV 3、MRV 3-jin-1和MRV 3-T3D S2基因的核苷酸同源性最低,在2.4%～5.5%之间。遗传进化树分析显示:ARV C-98和ARV T-98分离株与参考毒株共分为4个遗传进化分支。 |
| 关 键 词： | 禽呼肠孤病毒 S2基因 RT-PCR 克隆 序列分析 |
Cloning and Sequence Analysis of S2 Gene of Avian Reovirus C-98 and T-98 Strains |
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| HE Jian-wen , DANG Juan , GUAN Ping-yuan , LI Ping-an , GAO Kui.Cloning and Sequence Analysis of S2 Gene of Avian Reovirus C-98 and T-98 Strains[J].Animal Husbandry and Feed Science,2013,34(1):18-23. | |
| Authors: | HE Jian-wen DANG Juan GUAN Ping-yuan LI Ping-an GAO Kui |
| Institution: | 1.College of Veterinary Medicine,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010018,China;2.Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Technology in Animal Disease,Ministry of Agriculture,Hohhot 010018,China;3.Bureau of Veterinary Medicine of Dongsheng Distract in Ordos City,Dongsheng 017000,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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