杜仲雌花芽2个发育时期转录组分析 |
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引用本文: | 朱利利,庆军,何凤,杜庆鑫,杜红岩.杜仲雌花芽2个发育时期转录组分析[J].分子植物育种,2020(4):1123-1130. |
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作者姓名: | 朱利利 庆军 何凤 杜庆鑫 杜红岩 |
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作者单位: | 中国林业科学研究院经济林研究开发中心 |
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基金项目: | “十三五”国家重点研发计划(2017YFD0600702)资助。 |
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摘 要: | 杜仲(Eucommia ulmoides)的果实是提取杜仲胶和杜仲籽油的重要原材料,在工业、医疗、食品等领域开发前景广阔。为了揭示雌蕊原基发育相关基因的表达情况,本研究以杜仲果用良种‘华仲6号’(Huazhong No.6)为材料,利用lllumina Hiseq X-10高通量测序平台,分别对花序原基分化期和雌蕊原基分化期的花芽进行转录组测序,通过生物信息学对2个发育时期的雌花芽转录组进行比较分析,筛选出与杜仲雌蕊原基发育相关的差异基因。结果显示,转录组测序共获得68.11 Gb数据,各样品的Clean reads与杜仲基因组进行序列比对,比对效率为91.59%~92.05%,同时2个发育时期共筛选出485个差异表达基因,其中219个差异基因在雌蕊原基分化期表达上调,266个表达下调。差异基因GO富集结果表明,花的发育、光周期现象、激素生物合成以及蛋白结合转录因子活性等相关的生物途径被富集。KEGG富集结果表明淀粉和蔗糖代谢、碳代谢、昼夜节律和植物激素信号转导等代谢通路被富集。结果表明光周期途径是诱导杜仲成花的重要途径,且雌蕊原基发育受碳水化合物、植物激素和其他代谢物质调控。本研究为杜仲花器官发育调控基因的挖掘提供了基础数据,也为果用杜仲的分子育种提供了参考。
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关 键 词: | 杜仲 雌花芽 2个发育时期 转录组分析 |
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