NaCl胁迫下柳树的转录组测序与初步分析 |
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引用本文: | 李佳迪,李子英,丛日春.NaCl胁迫下柳树的转录组测序与初步分析[J].分子植物育种,2020(9):2835-2841. |
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作者姓名: | 李佳迪 李子英 丛日春 |
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作者单位: | 中国林业科学研究院荒漠化研究所;国际泥沙研究培训中心 |
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基金项目: | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(CAFYBB2016MA011)资助。 |
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摘 要: | 从组学水平分析盐胁迫下柳树内在分子机制,为柳树耐盐研究及耐盐基因的挖掘利用提供理论依据。本研究通过转录组测序技术对‘盐柳1号’(Salix psammophila’Yanliu No.1’)和‘渤海柳1号’(Salix matsudana’Bohailiu No.1’)经150 mmol/L NaCl胁迫处理后的叶片和正常叶片(对照)进行高通量转录组测序,并对获得的unigene进行从头组装和注释分析。结果表明:转录组测序共获得183987条Unigenes,平均长度为1080.18 bp,分别有120130条、140813条、98066条、88425条、47982条、83732条Unigenes被注释到NT、NR、COG、SwissProt、KEGG、COG和GO数据库,共有149864条(81.45%)Unigenes得到注释。在GO功能注释中,共得到55个GO功能小类,在KEGG代谢通路分析时,获得了135条KEGG通路。该转录组测序数据质量高,结果覆盖面广,为柳树耐盐基因挖掘和研究提供了一定的理论参考。
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关 键 词: | '盐柳1号’ '渤海柳1号’ 盐胁迫 高通量测序 转录组分析 |
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