首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

NaCl胁迫下柳树的转录组测序与初步分析
引用本文:李佳迪,李子英,丛日春.NaCl胁迫下柳树的转录组测序与初步分析[J].分子植物育种,2020(9):2835-2841.
作者姓名:李佳迪  李子英  丛日春
作者单位:中国林业科学研究院荒漠化研究所;国际泥沙研究培训中心
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(CAFYBB2016MA011)资助。
摘    要:从组学水平分析盐胁迫下柳树内在分子机制,为柳树耐盐研究及耐盐基因的挖掘利用提供理论依据。本研究通过转录组测序技术对‘盐柳1号’(Salix psammophila’Yanliu No.1’)和‘渤海柳1号’(Salix matsudana’Bohailiu No.1’)经150 mmol/L NaCl胁迫处理后的叶片和正常叶片(对照)进行高通量转录组测序,并对获得的unigene进行从头组装和注释分析。结果表明:转录组测序共获得183987条Unigenes,平均长度为1080.18 bp,分别有120130条、140813条、98066条、88425条、47982条、83732条Unigenes被注释到NT、NR、COG、SwissProt、KEGG、COG和GO数据库,共有149864条(81.45%)Unigenes得到注释。在GO功能注释中,共得到55个GO功能小类,在KEGG代谢通路分析时,获得了135条KEGG通路。该转录组测序数据质量高,结果覆盖面广,为柳树耐盐基因挖掘和研究提供了一定的理论参考。

关 键 词:'盐柳1号’  '渤海柳1号’  盐胁迫  高通量测序  转录组分析
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号