| 山胡椒LgCMK基因克隆与生物信息学预测分析 |
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| 引用本文： | 张金松,林子欣,胡锦赫,安基永,王佳,林善枝.山胡椒LgCMK基因克隆与生物信息学预测分析[J].分子植物育种,2020(7):2167-2173. |
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| 作者姓名： | 张金松 林子欣 胡锦赫 安基永 王佳 林善枝 |
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| 作者单位： | 北京林业大学生物科学与技术学院 |
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| 基金项目： | “十二五”农村领域国家科技计划课题(2013BAD01B06-2)资助。 |
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| 摘 要： | CMK是MEP途径中的第四个关键酶,对于萜类合成代谢具有重要的影响。本研究基于实验室前期获得的山胡椒果实的转录组数据,经过注释筛选出CMK基因,首次从山胡椒中克隆得到萜类生物合成关键基因LgCMK并对其生物信息学预测分析。结果显示:LgCMK基因的开放阅读框为1 221 bp,编码406个氨基酸,分子量为44.78 k D,理论上等电点为6.26,属GHMP蛋白超家族。对Lg CMK蛋白的氨基酸序列理化性质进行分析,发现蛋白亲水性指数为-0.332,不稳定性指数为41.77,属于亲水性不稳定蛋白;亚细胞定位预测结果显示该蛋白定位于叶绿体中。同源性和系统进化分析结果表明,与香樟、博落回和罂粟同源蛋白相似度较高分别为96.8%、75.96%和73.0%,不同物种的CMK具有较近的亲缘关系,与香樟同属一支,亲缘关系最近。通过本研究生物信息学分析将有助于对LgCMK深层次功能探究提供借鉴作用,同时为山胡椒的种质改良提供基因资源。
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| 关 键 词： | 山胡椒(Lindera glauca) LgCMK 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of LgCMK Gene in Lindera glauca |
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| Zhang Jinsong,Lin Zixin,Hu Jinhe,An Jiyong,Wang Jia,Lin Shanzhi.Cloning and Bioinformatics Analysis of LgCMK Gene in Lindera glauca[J].Molecular Plant Breeding,2020(7):2167-2173. |
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| Authors: | Zhang Jinsong Lin Zixin Hu Jinhe An Jiyong Wang Jia Lin Shanzhi |
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| Institution: | (College of Biological Science and Technology,Beijing Forestry University,Beijing,100083) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lindera glauca LgCMK Gene cloning Bioinformatics analysis |
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