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玉米基因组Fosmid文库构建及类受体激酶基因(Psy1和Psy2)筛选
引用本文:吴晓军,徐丽,王守才.玉米基因组Fosmid文库构建及类受体激酶基因(Psy1和Psy2)筛选[J].农业生物技术学报,2014,22(10).
作者姓名:吴晓军  徐丽  王守才
作者单位:中国农业大学国家玉米改良中心,北京,100193
基金项目:国家高新技术研究与发展计划(863),国家重点基础研究发展计划(973)
摘    要:玉米(Zea mays L.)病害的发生和流行是限制玉米高产稳产的重要因素。玉米细菌性褐斑病是目前具有潜在危害性的病害之一,在抗性基因遗传规律和染色体定位研究方面取得一定进展,但在基因克隆、功能鉴定等研究上进展较为缓慢,利用构建的Fosmid文库克隆抗病候选基因是目前较为快捷和有效的方法之一。本研究以玉米细菌性褐斑病的抗病自交系F349为材料构建了玉米Fosmid文库,克隆总数约为3.7×105个,平均插入片段长度为32 kb,实现4.73倍的玉米基因组覆盖,筛选到任意基因或序列的概率达到了99.12%。基于该文库,利用不同引物组合进行了两个类受体蛋白激酶基因(Psy1和Psy2)的克隆筛选,得到14个阳性克隆,其中4个阳性克隆包含Psy2基因和Psy1基因部分片段;3个阳性克隆包含完整Psy1基因;对其中两个阳性克隆13-12F-23和32-4A-6的测序结果显示,Psy1基因的启动子和内含子分别被插入了10.0和13.5 kb的外源片段;13.5 kb的插入片段是LTR家族的huck反转录转座子,10.0 kb的插入片段是含有helitron转座元件的复杂转座子;扩增到了Psy1基因的cDNA全长,说明这两种类型反转录转座子的插入并未使基因失活。本研究为玉米基因的克隆和功能分析提供了一种可行的研究途径。

关 键 词:玉米  Fosmid文库  转座子

Construction of Maize(Zea mays L.) Genomic Fosmid Library and Screening of Receptor-like Kinase Genes(Psy1 and Psy2)
WU Xiao-Jun,XU Li,WANG Shou-Cai.Construction of Maize(Zea mays L.) Genomic Fosmid Library and Screening of Receptor-like Kinase Genes(Psy1 and Psy2)[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2014,22(10).
Authors:WU Xiao-Jun  XU Li  WANG Shou-Cai
Abstract:
Keywords:Zea mays L    Fosmid library  Transposon
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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