香蕉穿孔线虫β-1,4-内切葡聚糖酶基因的克隆与特征分析 |
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引用本文: | 肖罗,陈国华,戴良英,吕春花,杨宇红,谢丙炎.香蕉穿孔线虫β-1,4-内切葡聚糖酶基因的克隆与特征分析[J].园艺学报,2008,35(10):1431-1440. |
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作者姓名: | 肖罗 陈国华 戴良英 吕春花 杨宇红 谢丙炎 |
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作者单位: | (湖南农业大学生物安全科学技术学院,长沙410128;中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081) |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划),国家高技术研究发展计划(863计划),国家科技支撑计划,公益性行业(农业)科研专项经费项目 |
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摘 要: | 植物寄生线虫的分泌物在线虫的侵染过程中具有重要的作用,其中纤维素水解酶是研究的较多的主要分泌物之一。采用RT-PCR和RACE方法,从香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)中获得编码β-1,4-内切葡聚糖酶基因的cDNA序列,命名为RS-eng-1 (GenBank登录号为EU414839)。该cDNA序列全长为1 630 bp,包含一个1 404 bp的开放阅读框(ORF),编码含467个氨基酸的蛋白,理论分子量与等电点分别为48.22 kD和6.04。序列分析表明该酶含有糖基水解酶家族5(GHF5)的保守结构域,N端具有22个氨基酸残基组成的信号肽,C端含有细菌式样的纤维素结合域(CBDⅡ)。原位杂交结果显示此基因在相似穿孔线虫的食道腺部位表达,并且Southern结果显示其为多拷贝基因。cDNA与基因组DNA重叠分析表明,此基因包含6个内含子,切割点符合5'-GT...AG-3'的规律。进化分析显示该酶与细菌Bacillus subtilis和Erwina carotovora 分泌的纤维素酶属于同一支,推测其来源于细菌的水平基因转移。
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关 键 词: | 香蕉穿孔线虫 香蕉 β-1 4-内切葡聚糖酶 GHF5家族 原位杂交 |
收稿时间: | 2008-07-16 |
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