| 红灯笼猪种质资源鉴定及其特异性基因位点挖掘 |
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| 引用本文： | 刘晨曦,侯黎明,周五朵,徐燕,程跃强,陈珉,金松,李平华,黄瑞华.红灯笼猪种质资源鉴定及其特异性基因位点挖掘[J].畜牧与兽医,2022(5):26-33. |
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| 作者姓名： | 刘晨曦 侯黎明 周五朵 徐燕 程跃强 陈珉 金松 李平华 黄瑞华 |
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| 作者单位： | 1. 南京农业大学养猪研究所/农业农村部猪遗传资源评价与利用重点实验室(南京);2. 南京农业大学淮安研究院;3. 江苏省畜牧总站;5. 溧阳市畜牧兽医站;6. 常州市动物疫病预防控制中心 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2021YFD1301100)；;国家自然科学基金面上项目(32172710)； |
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| 摘 要： | 红灯笼猪是优质的江苏省地方畜禽资源。为探明红灯笼猪种质特异性，解析其种质特性背后的关键基因位点，本试验选取了包括红灯笼猪、米猪和淮猪在内的45个欧亚猪种1 228头猪的基因组数据，通过邻接系统发育树、遗传距离、遗传分化系数、祖先血统组成K分析(K postulated ancestral populations)以及位点特异性分枝长度(locus-specific branch length, LSBL)分析等进行整合分析。结果显示：红灯笼猪在邻接系统发育树分析中独立成簇，没有与其他猪种交叉。在遗传距离和遗传分化系数分析中，红灯笼猪与其他猪种，包括淮猪和米猪，都保持较远的遗传距离和遗传分化，这种差异甚至超过了梅山和二花脸等现有确认的地方猪种间差异。此外，在祖先血统组成分析中，红灯笼猪在K=39时，形成了独立的祖先血统组成，此时的二花脸和米猪仍共享同一个祖先血统，表明红灯笼猪进化路线特异。最后通过将红灯笼猪、米猪和淮猪进行LSBL分析，结果发现相关位点所注释到的基因主要富集在生长代谢、抗病性和神经发育等功能上，表明红灯笼猪在种质形成过程中，相关性状受到选择。本试验确定了红灯笼猪的品种独立...
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| 关 键 词： | 红灯笼猪 品种鉴定 种质特性 |
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